Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BATF3Q9NR55 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BATF3Q9NR55 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BATF3Q9NR55 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BATF3Q9NR55 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BATF3Q9NR55 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BATF3Q9NR55 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BATF3Q9NR55 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BATF3Q9NR55 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BATF3Q9NR55 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BATF3Q9NR55 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BATF3Q9NR55 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BATF3Q9NR55 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BATF3Q9NR55 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BATF3Q9NR55 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BATF3Q9NR55 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BATF3Q9NR55 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BATF3Q9NR55 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BATF3Q9NR55 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BATF3Q9NR55 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BATF3Q9NR55 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BATF3Q9NR55 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BATF3Q9NR55 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BATF3Q9NR55 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BATF3Q9NR55 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BATF3Q9NR55 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BATF3Q9NR55 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
BATF3Q9NR55 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BATF3Q9NR55 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BATF3Q9NR55 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BATF3Q9NR55 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BATF3Q9NR55 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BATF3Q9NR55 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BATF3Q9NR55 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BATF3Q9NR55 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BATF3Q9NR55 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BATF3Q9NR55 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BATF3Q9NR55 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BATF3Q9NR55 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BATF3Q9NR55 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BATF3Q9NR55 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BATF3Q9NR55 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BATF3Q9NR55 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BATF3Q9NR55 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BATF3Q9NR55 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BATF3Q9NR55 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BATF3Q9NR55 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BATF3Q9NR55 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BATF3Q9NR55 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BATF3Q9NR55 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BATF3Q9NR55 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
BATF3Q9NR55 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BATF3Q9NR55 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BATF3Q9NR55 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BATF3Q9NR55 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BATF3Q9NR55 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BATF3Q9NR55 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
BATF3Q9NR55 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BATF3Q9NR55 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BATF3Q9NR55 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BATF3Q9NR55 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BATF3Q9NR55 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BATF3Q9NR55 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BATF3Q9NR55 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BATF3Q9NR55 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BATF3Q9NR55 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BATF3Q9NR55 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BATF3Q9NR55 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BATF3Q9NR55 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BATF3Q9NR55 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
BATF3Q9NR55 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BATF3Q9NR55 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BATF3Q9NR55 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BATF3Q9NR55 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BATF3Q9NR55 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BATF3Q9NR55 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
BATF3Q9NR55 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BATF3Q9NR55 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BATF3Q9NR55 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BATF3Q9NR55 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BATF3Q9NR55 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BATF3Q9NR55 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BATF3Q9NR55 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BATF3Q9NR55 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BATF3Q9NR55 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BATF3Q9NR55 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BATF3Q9NR55 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BATF3Q9NR55 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BATF3Q9NR55 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BATF3Q9NR55 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BATF3Q9NR55 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BATF3Q9NR55 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BATF3Q9NR55 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BATF3Q9NR55 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BATF3Q9NR55 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BATF3Q9NR55 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BATF3Q9NR55 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BATF3Q9NR55 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BATF3Q9NR55 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BATF3Q9NR55 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms