Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E4

GRIP2, Glutamate receptor-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIP2Q9C0E4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIP2Q9C0E4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIP2Q9C0E4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIP2Q9C0E4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIP2Q9C0E4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIP2Q9C0E4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIP2Q9C0E4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIP2Q9C0E4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIP2Q9C0E4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIP2Q9C0E4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIP2Q9C0E4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIP2Q9C0E4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIP2Q9C0E4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIP2Q9C0E4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIP2Q9C0E4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIP2Q9C0E4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIP2Q9C0E4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIP2Q9C0E4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRIP2Q9C0E4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIP2Q9C0E4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIP2Q9C0E4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIP2Q9C0E4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIP2Q9C0E4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIP2Q9C0E4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIP2Q9C0E4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIP2Q9C0E4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIP2Q9C0E4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIP2Q9C0E4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIP2Q9C0E4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIP2Q9C0E4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIP2Q9C0E4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIP2Q9C0E4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIP2Q9C0E4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIP2Q9C0E4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIP2Q9C0E4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIP2Q9C0E4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIP2Q9C0E4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIP2Q9C0E4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIP2Q9C0E4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIP2Q9C0E4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIP2Q9C0E4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIP2Q9C0E4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIP2Q9C0E4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIP2Q9C0E4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIP2Q9C0E4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIP2Q9C0E4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIP2Q9C0E4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIP2Q9C0E4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIP2Q9C0E4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIP2Q9C0E4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIP2Q9C0E4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIP2Q9C0E4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIP2Q9C0E4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIP2Q9C0E4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIP2Q9C0E4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIP2Q9C0E4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIP2Q9C0E4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIP2Q9C0E4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIP2Q9C0E4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIP2Q9C0E4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIP2Q9C0E4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIP2Q9C0E4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIP2Q9C0E4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIP2Q9C0E4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIP2Q9C0E4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIP2Q9C0E4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIP2Q9C0E4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIP2Q9C0E4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIP2Q9C0E4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIP2Q9C0E4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIP2Q9C0E4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIP2Q9C0E4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
GRIP2Q9C0E4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIP2Q9C0E4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIP2Q9C0E4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIP2Q9C0E4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIP2Q9C0E4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIP2Q9C0E4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIP2Q9C0E4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIP2Q9C0E4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIP2Q9C0E4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIP2Q9C0E4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIP2Q9C0E4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIP2Q9C0E4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIP2Q9C0E4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIP2Q9C0E4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GRIP2Q9C0E4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIP2Q9C0E4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIP2Q9C0E4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIP2Q9C0E4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIP2Q9C0E4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIP2Q9C0E4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIP2Q9C0E4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIP2Q9C0E4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIP2Q9C0E4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIP2Q9C0E4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIP2Q9C0E4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIP2Q9C0E4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIP2Q9C0E4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIP2Q9C0E4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms