Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC4A5Q9BY07 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC4A5Q9BY07 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC4A5Q9BY07 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC4A5Q9BY07 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC4A5Q9BY07 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC4A5Q9BY07 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC4A5Q9BY07 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC4A5Q9BY07 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC4A5Q9BY07 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC4A5Q9BY07 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC4A5Q9BY07 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC4A5Q9BY07 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC4A5Q9BY07 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC4A5Q9BY07 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC4A5Q9BY07 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC4A5Q9BY07 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC4A5Q9BY07 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC4A5Q9BY07 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC4A5Q9BY07 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC4A5Q9BY07 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC4A5Q9BY07 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC4A5Q9BY07 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC4A5Q9BY07 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC4A5Q9BY07 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC4A5Q9BY07 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC4A5Q9BY07 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
SLC4A5Q9BY07 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC4A5Q9BY07 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC4A5Q9BY07 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC4A5Q9BY07 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC4A5Q9BY07 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC4A5Q9BY07 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC4A5Q9BY07 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLC4A5Q9BY07 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLC4A5Q9BY07 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SLC4A5Q9BY07 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SLC4A5Q9BY07 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SLC4A5Q9BY07 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC4A5Q9BY07 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC4A5Q9BY07 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC4A5Q9BY07 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC4A5Q9BY07 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC4A5Q9BY07 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC4A5Q9BY07 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC4A5Q9BY07 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC4A5Q9BY07 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC4A5Q9BY07 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC4A5Q9BY07 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC4A5Q9BY07 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC4A5Q9BY07 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC4A5Q9BY07 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC4A5Q9BY07 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC4A5Q9BY07 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC4A5Q9BY07 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC4A5Q9BY07 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC4A5Q9BY07 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC4A5Q9BY07 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC4A5Q9BY07 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC4A5Q9BY07 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC4A5Q9BY07 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC4A5Q9BY07 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC4A5Q9BY07 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC4A5Q9BY07 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC4A5Q9BY07 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC4A5Q9BY07 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC4A5Q9BY07 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC4A5Q9BY07 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC4A5Q9BY07 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC4A5Q9BY07 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC4A5Q9BY07 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC4A5Q9BY07 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC4A5Q9BY07 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC4A5Q9BY07 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC4A5Q9BY07 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC4A5Q9BY07 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC4A5Q9BY07 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC4A5Q9BY07 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC4A5Q9BY07 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC4A5Q9BY07 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC4A5Q9BY07 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC4A5Q9BY07 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC4A5Q9BY07 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC4A5Q9BY07 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC4A5Q9BY07 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC4A5Q9BY07 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC4A5Q9BY07 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC4A5Q9BY07 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC4A5Q9BY07 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC4A5Q9BY07 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC4A5Q9BY07 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC4A5Q9BY07 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC4A5Q9BY07 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC4A5Q9BY07 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC4A5Q9BY07 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC4A5Q9BY07 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC4A5Q9BY07 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC4A5Q9BY07 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC4A5Q9BY07 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC4A5Q9BY07 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms