Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRG1

VPS25, Vacuolar protein-sorting-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS25Q9BRG1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VPS25Q9BRG1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VPS25Q9BRG1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VPS25Q9BRG1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VPS25Q9BRG1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
VPS25Q9BRG1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VPS25Q9BRG1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
VPS25Q9BRG1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VPS25Q9BRG1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VPS25Q9BRG1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VPS25Q9BRG1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VPS25Q9BRG1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VPS25Q9BRG1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VPS25Q9BRG1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VPS25Q9BRG1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VPS25Q9BRG1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VPS25Q9BRG1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VPS25Q9BRG1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VPS25Q9BRG1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VPS25Q9BRG1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VPS25Q9BRG1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VPS25Q9BRG1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VPS25Q9BRG1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VPS25Q9BRG1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VPS25Q9BRG1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VPS25Q9BRG1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
VPS25Q9BRG1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS25Q9BRG1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS25Q9BRG1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS25Q9BRG1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS25Q9BRG1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS25Q9BRG1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS25Q9BRG1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS25Q9BRG1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS25Q9BRG1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS25Q9BRG1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS25Q9BRG1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS25Q9BRG1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS25Q9BRG1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS25Q9BRG1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS25Q9BRG1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS25Q9BRG1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VPS25Q9BRG1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS25Q9BRG1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS25Q9BRG1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS25Q9BRG1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VPS25Q9BRG1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS25Q9BRG1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS25Q9BRG1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS25Q9BRG1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VPS25Q9BRG1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VPS25Q9BRG1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VPS25Q9BRG1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VPS25Q9BRG1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VPS25Q9BRG1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VPS25Q9BRG1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VPS25Q9BRG1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VPS25Q9BRG1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VPS25Q9BRG1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VPS25Q9BRG1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VPS25Q9BRG1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VPS25Q9BRG1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VPS25Q9BRG1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VPS25Q9BRG1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VPS25Q9BRG1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
VPS25Q9BRG1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VPS25Q9BRG1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VPS25Q9BRG1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VPS25Q9BRG1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VPS25Q9BRG1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VPS25Q9BRG1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VPS25Q9BRG1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VPS25Q9BRG1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VPS25Q9BRG1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS25Q9BRG1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS25Q9BRG1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS25Q9BRG1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VPS25Q9BRG1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VPS25Q9BRG1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VPS25Q9BRG1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VPS25Q9BRG1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VPS25Q9BRG1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VPS25Q9BRG1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VPS25Q9BRG1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VPS25Q9BRG1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VPS25Q9BRG1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VPS25Q9BRG1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VPS25Q9BRG1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VPS25Q9BRG1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VPS25Q9BRG1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS25Q9BRG1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS25Q9BRG1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS25Q9BRG1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS25Q9BRG1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS25Q9BRG1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS25Q9BRG1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS25Q9BRG1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS25Q9BRG1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS25Q9BRG1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS25Q9BRG1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms