Protein–RNA interactions for Protein: Q99805

TM9SF2, Transmembrane 9 superfamily member 2, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF2Q99805 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TM9SF2Q99805 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TM9SF2Q99805 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TM9SF2Q99805 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TM9SF2Q99805 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TM9SF2Q99805 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TM9SF2Q99805 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TM9SF2Q99805 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TM9SF2Q99805 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TM9SF2Q99805 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TM9SF2Q99805 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TM9SF2Q99805 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TM9SF2Q99805 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TM9SF2Q99805 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TM9SF2Q99805 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TM9SF2Q99805 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TM9SF2Q99805 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TM9SF2Q99805 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TM9SF2Q99805 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TM9SF2Q99805 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TM9SF2Q99805 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TM9SF2Q99805 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TM9SF2Q99805 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TM9SF2Q99805 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TM9SF2Q99805 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TM9SF2Q99805 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TM9SF2Q99805 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TM9SF2Q99805 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TM9SF2Q99805 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TM9SF2Q99805 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TM9SF2Q99805 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TM9SF2Q99805 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TM9SF2Q99805 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TM9SF2Q99805 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TM9SF2Q99805 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TM9SF2Q99805 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TM9SF2Q99805 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TM9SF2Q99805 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TM9SF2Q99805 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TM9SF2Q99805 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TM9SF2Q99805 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TM9SF2Q99805 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TM9SF2Q99805 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TM9SF2Q99805 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TM9SF2Q99805 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TM9SF2Q99805 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TM9SF2Q99805 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TM9SF2Q99805 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TM9SF2Q99805 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TM9SF2Q99805 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TM9SF2Q99805 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TM9SF2Q99805 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TM9SF2Q99805 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TM9SF2Q99805 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TM9SF2Q99805 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TM9SF2Q99805 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TM9SF2Q99805 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TM9SF2Q99805 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TM9SF2Q99805 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TM9SF2Q99805 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TM9SF2Q99805 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TM9SF2Q99805 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TM9SF2Q99805 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TM9SF2Q99805 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TM9SF2Q99805 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TM9SF2Q99805 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TM9SF2Q99805 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TM9SF2Q99805 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TM9SF2Q99805 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TM9SF2Q99805 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TM9SF2Q99805 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TM9SF2Q99805 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TM9SF2Q99805 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TM9SF2Q99805 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TM9SF2Q99805 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TM9SF2Q99805 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TM9SF2Q99805 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TM9SF2Q99805 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TM9SF2Q99805 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TM9SF2Q99805 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TM9SF2Q99805 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TM9SF2Q99805 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TM9SF2Q99805 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TM9SF2Q99805 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TM9SF2Q99805 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TM9SF2Q99805 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TM9SF2Q99805 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TM9SF2Q99805 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TM9SF2Q99805 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TM9SF2Q99805 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TM9SF2Q99805 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TM9SF2Q99805 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TM9SF2Q99805 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TM9SF2Q99805 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TM9SF2Q99805 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TM9SF2Q99805 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TM9SF2Q99805 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TM9SF2Q99805 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TM9SF2Q99805 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TM9SF2Q99805 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms