Protein–RNA interactions for Protein: Q96RI1

NR1H4, Bile acid receptor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H4Q96RI1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NR1H4Q96RI1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NR1H4Q96RI1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NR1H4Q96RI1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NR1H4Q96RI1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NR1H4Q96RI1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NR1H4Q96RI1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NR1H4Q96RI1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NR1H4Q96RI1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NR1H4Q96RI1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NR1H4Q96RI1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NR1H4Q96RI1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NR1H4Q96RI1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NR1H4Q96RI1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NR1H4Q96RI1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NR1H4Q96RI1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NR1H4Q96RI1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NR1H4Q96RI1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NR1H4Q96RI1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NR1H4Q96RI1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NR1H4Q96RI1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NR1H4Q96RI1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NR1H4Q96RI1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NR1H4Q96RI1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NR1H4Q96RI1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NR1H4Q96RI1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NR1H4Q96RI1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NR1H4Q96RI1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NR1H4Q96RI1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NR1H4Q96RI1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NR1H4Q96RI1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NR1H4Q96RI1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NR1H4Q96RI1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NR1H4Q96RI1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NR1H4Q96RI1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NR1H4Q96RI1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NR1H4Q96RI1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NR1H4Q96RI1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NR1H4Q96RI1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NR1H4Q96RI1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NR1H4Q96RI1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NR1H4Q96RI1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NR1H4Q96RI1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NR1H4Q96RI1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NR1H4Q96RI1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NR1H4Q96RI1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NR1H4Q96RI1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NR1H4Q96RI1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NR1H4Q96RI1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NR1H4Q96RI1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NR1H4Q96RI1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NR1H4Q96RI1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NR1H4Q96RI1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NR1H4Q96RI1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NR1H4Q96RI1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NR1H4Q96RI1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NR1H4Q96RI1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NR1H4Q96RI1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NR1H4Q96RI1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NR1H4Q96RI1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NR1H4Q96RI1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NR1H4Q96RI1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NR1H4Q96RI1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NR1H4Q96RI1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NR1H4Q96RI1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NR1H4Q96RI1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NR1H4Q96RI1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NR1H4Q96RI1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NR1H4Q96RI1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NR1H4Q96RI1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NR1H4Q96RI1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NR1H4Q96RI1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NR1H4Q96RI1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NR1H4Q96RI1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NR1H4Q96RI1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NR1H4Q96RI1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NR1H4Q96RI1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NR1H4Q96RI1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NR1H4Q96RI1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NR1H4Q96RI1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NR1H4Q96RI1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NR1H4Q96RI1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NR1H4Q96RI1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NR1H4Q96RI1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NR1H4Q96RI1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NR1H4Q96RI1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NR1H4Q96RI1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NR1H4Q96RI1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NR1H4Q96RI1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NR1H4Q96RI1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR1H4Q96RI1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR1H4Q96RI1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR1H4Q96RI1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR1H4Q96RI1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NR1H4Q96RI1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NR1H4Q96RI1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NR1H4Q96RI1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NR1H4Q96RI1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NR1H4Q96RI1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NR1H4Q96RI1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms