Protein–RNA interactions for Protein: Q8TCA0

LRRC20, Leucine-rich repeat-containing protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC20Q8TCA0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC20Q8TCA0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC20Q8TCA0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC20Q8TCA0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC20Q8TCA0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC20Q8TCA0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC20Q8TCA0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC20Q8TCA0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC20Q8TCA0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC20Q8TCA0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC20Q8TCA0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC20Q8TCA0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC20Q8TCA0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC20Q8TCA0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC20Q8TCA0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC20Q8TCA0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC20Q8TCA0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC20Q8TCA0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC20Q8TCA0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC20Q8TCA0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC20Q8TCA0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRRC20Q8TCA0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRRC20Q8TCA0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC20Q8TCA0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC20Q8TCA0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC20Q8TCA0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC20Q8TCA0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC20Q8TCA0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC20Q8TCA0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC20Q8TCA0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC20Q8TCA0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC20Q8TCA0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC20Q8TCA0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC20Q8TCA0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC20Q8TCA0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC20Q8TCA0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC20Q8TCA0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC20Q8TCA0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC20Q8TCA0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC20Q8TCA0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC20Q8TCA0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC20Q8TCA0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC20Q8TCA0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC20Q8TCA0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC20Q8TCA0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC20Q8TCA0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC20Q8TCA0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC20Q8TCA0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC20Q8TCA0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC20Q8TCA0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC20Q8TCA0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC20Q8TCA0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC20Q8TCA0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LRRC20Q8TCA0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LRRC20Q8TCA0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LRRC20Q8TCA0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC20Q8TCA0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC20Q8TCA0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC20Q8TCA0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC20Q8TCA0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC20Q8TCA0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC20Q8TCA0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC20Q8TCA0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC20Q8TCA0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC20Q8TCA0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC20Q8TCA0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC20Q8TCA0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC20Q8TCA0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC20Q8TCA0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC20Q8TCA0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC20Q8TCA0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC20Q8TCA0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC20Q8TCA0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC20Q8TCA0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC20Q8TCA0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC20Q8TCA0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC20Q8TCA0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC20Q8TCA0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC20Q8TCA0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC20Q8TCA0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC20Q8TCA0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC20Q8TCA0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC20Q8TCA0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC20Q8TCA0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC20Q8TCA0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC20Q8TCA0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC20Q8TCA0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC20Q8TCA0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC20Q8TCA0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC20Q8TCA0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC20Q8TCA0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC20Q8TCA0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC20Q8TCA0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC20Q8TCA0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC20Q8TCA0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC20Q8TCA0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC20Q8TCA0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC20Q8TCA0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC20Q8TCA0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC20Q8TCA0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms