Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM1

ZNF680, Zinc finger protein 680, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF680Q8NEM1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF680Q8NEM1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF680Q8NEM1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF680Q8NEM1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF680Q8NEM1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF680Q8NEM1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF680Q8NEM1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF680Q8NEM1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF680Q8NEM1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF680Q8NEM1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF680Q8NEM1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF680Q8NEM1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF680Q8NEM1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF680Q8NEM1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF680Q8NEM1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF680Q8NEM1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF680Q8NEM1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF680Q8NEM1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF680Q8NEM1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF680Q8NEM1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF680Q8NEM1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF680Q8NEM1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF680Q8NEM1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF680Q8NEM1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF680Q8NEM1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF680Q8NEM1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF680Q8NEM1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF680Q8NEM1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF680Q8NEM1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF680Q8NEM1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF680Q8NEM1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF680Q8NEM1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF680Q8NEM1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF680Q8NEM1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF680Q8NEM1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF680Q8NEM1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF680Q8NEM1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF680Q8NEM1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF680Q8NEM1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF680Q8NEM1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF680Q8NEM1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF680Q8NEM1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF680Q8NEM1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF680Q8NEM1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF680Q8NEM1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF680Q8NEM1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF680Q8NEM1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF680Q8NEM1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF680Q8NEM1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF680Q8NEM1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF680Q8NEM1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF680Q8NEM1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF680Q8NEM1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF680Q8NEM1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF680Q8NEM1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF680Q8NEM1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF680Q8NEM1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF680Q8NEM1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF680Q8NEM1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF680Q8NEM1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF680Q8NEM1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF680Q8NEM1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF680Q8NEM1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF680Q8NEM1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF680Q8NEM1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF680Q8NEM1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF680Q8NEM1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF680Q8NEM1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF680Q8NEM1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF680Q8NEM1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF680Q8NEM1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF680Q8NEM1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF680Q8NEM1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZNF680Q8NEM1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF680Q8NEM1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF680Q8NEM1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF680Q8NEM1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF680Q8NEM1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF680Q8NEM1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF680Q8NEM1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF680Q8NEM1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF680Q8NEM1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF680Q8NEM1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF680Q8NEM1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF680Q8NEM1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF680Q8NEM1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF680Q8NEM1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF680Q8NEM1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF680Q8NEM1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF680Q8NEM1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF680Q8NEM1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF680Q8NEM1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF680Q8NEM1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF680Q8NEM1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF680Q8NEM1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF680Q8NEM1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF680Q8NEM1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF680Q8NEM1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF680Q8NEM1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF680Q8NEM1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.7 ms