Protein–RNA interactions for Protein: Q7KZF4

SND1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SND1Q7KZF4 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.326e-10■■■■■ 42.6
SND1Q7KZF4 A1BG-205ENST00000600966 917 ntTSL 518.59■□□□□ 0.576e-8■■■■■ 42.5
SND1Q7KZF4 GRN-202ENST00000585348 600 ntTSL 212.18□□□□□ -0.462e-12■■■■■ 42.4
SND1Q7KZF4 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.481e-8■■■■■ 42.2
SND1Q7KZF4 CLDN4-203ENST00000435050 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.291e-8■■■■■ 42.2
SND1Q7KZF4 CLDN4-202ENST00000431918 4108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.411e-8■■■■■ 42.2
SND1Q7KZF4 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.81e-323■■■■■ 42.2
SND1Q7KZF4 PRKCSH-210ENST00000589990 567 ntTSL 213.25□□□□□ -0.296e-16■■■■■ 42.1
SND1Q7KZF4 CYR61-202ENST00000480413 551 ntTSL 215.45■□□□□ 0.062e-11■■■■■ 42
SND1Q7KZF4 SPARC-206ENST00000524277 505 ntTSL 212.25□□□□□ -0.451e-9■■■■■ 41.9
SND1Q7KZF4 TTR-205ENST00000613781 556 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.961e-11■■■■■ 41.8
SND1Q7KZF4 TTR-204ENST00000610404 1040 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.961e-11■■■■■ 41.8
SND1Q7KZF4 TTR-201ENST00000237014 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.211e-11■■■■■ 41.8
SND1Q7KZF4 IDI1-205ENST00000491735 1066 ntTSL 1 (best)20.82■□□□□ 0.922e-16■■■■■ 41.8
SND1Q7KZF4 TMBIM6-222ENST00000550445 761 ntTSL 312.37□□□□□ -0.431e-12■■■■■ 41.8
SND1Q7KZF4 TTR-202ENST00000432547 745 ntTSL 28.29□□□□□ -1.084e-11■■■■■ 41.8
SND1Q7KZF4 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.151e-323■■■■■ 41.7
SND1Q7KZF4 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.151e-323■■■■■ 41.7
SND1Q7KZF4 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.121e-323■■■■■ 41.7
SND1Q7KZF4 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.151e-323■■■■■ 41.7
SND1Q7KZF4 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.151e-323■■■■■ 41.7
SND1Q7KZF4 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.013e-13■■■■■ 41.6
SND1Q7KZF4 CX3CL1-201ENST00000006053 3321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.533e-13■■■■■ 41.6
SND1Q7KZF4 CX3CL1-202ENST00000563383 3313 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.563e-13■■■■■ 41.6
SND1Q7KZF4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.182e-11■■■■■ 41.5
SND1Q7KZF4 SLC17A7-205ENST00000600672 2024 ntTSL 520.85■□□□□ 0.932e-11■■■■■ 41.5
SND1Q7KZF4 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.472e-11■■■■■ 41.5
SND1Q7KZF4 GALNT7-206ENST00000512285 1567 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.682e-11■■■■■ 41.5
SND1Q7KZF4 YIPF4-201ENST00000238831 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.872e-11■■■■■ 41.5
SND1Q7KZF4 YIPF4-202ENST00000437765 728 ntTSL 58.82□□□□□ -12e-11■■■■■ 41.5
SND1Q7KZF4 YIPF4-203ENST00000441084 312 ntTSL 36.39□□□□□ -1.392e-11■■■■■ 41.5
SND1Q7KZF4 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.094e-7■■■■■ 41.4
SND1Q7KZF4 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.084e-7■■■■■ 41.4
SND1Q7KZF4 LIPA-203ENST00000371837 2513 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.714e-7■■■■■ 41.4
SND1Q7KZF4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.43e-11■■■■■ 41.4
SND1Q7KZF4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.063e-11■■■■■ 41.4
SND1Q7KZF4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 13e-11■■■■■ 41.4
SND1Q7KZF4 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.813e-11■■■■■ 41.4
SND1Q7KZF4 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.674e-7■■■■■ 41.4
SND1Q7KZF4 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.63e-11■■■■■ 41.4
SND1Q7KZF4 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.553e-11■■■■■ 41.4
SND1Q7KZF4 TMEM175-216ENST00000513952 2084 ntTSL 1 (best)18.5■□□□□ 0.553e-11■■■■■ 41.4
SND1Q7KZF4 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.514e-7■■■■■ 41.4
SND1Q7KZF4 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.53e-11■■■■■ 41.4
SND1Q7KZF4 TMEM175-202ENST00000438836 2236 ntTSL 217.19■□□□□ 0.343e-11■■■■■ 41.4
SND1Q7KZF4 SLC12A9-212ENST00000482184 656 ntTSL 313.65□□□□□ -0.224e-7■■■■■ 41.4
SND1Q7KZF4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.396e-10■■■■■ 41.3
SND1Q7KZF4 EBP-201ENST00000276096 904 ntTSL 216.73■□□□□ 0.279e-10■■■■■ 41.2
SND1Q7KZF4 EBP-206ENST00000498425 796 ntTSL 315.32■□□□□ 0.049e-10■■■■■ 41.2
SND1Q7KZF4 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.029e-10■■■■■ 41.2
SND1Q7KZF4 PDIA3-204ENST00000455250 725 ntTSL 58.46□□□□□ -1.068e-11■■■■■ 41.2
SND1Q7KZF4 AL049779.1-203ENST00000554493 364 ntTSL 27.59□□□□□ -1.199e-8■■■■■ 40.9
SND1Q7KZF4 AL049779.1-202ENST00000553582 498 ntTSL 24.79□□□□□ -1.649e-8■■■■■ 40.9
SND1Q7KZF4 APOE-203ENST00000434152 864 ntTSL 221.02■□□□□ 0.967e-10■■■■■ 40.9
SND1Q7KZF4 TMBIM6-221ENST00000550040 952 ntTSL 27.84□□□□□ -1.152e-22■■■■■ 40.8
SND1Q7KZF4 TMBIM6-226ENST00000552635 574 ntTSL 49.83□□□□□ -0.841e-12■■■■■ 40.8
SND1Q7KZF4 TMBIM6-228ENST00000553022 540 ntTSL 28.55□□□□□ -1.041e-16■■■■■ 40.8
SND1Q7KZF4 SLC38A2-212ENST00000552703 528 ntTSL 27.05□□□□□ -1.289e-22■■■■■ 40.7
SND1Q7KZF4 STC2-204ENST00000520593 566 ntTSL 413.26□□□□□ -0.292e-10■■■■■ 40.6
SND1Q7KZF4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.665e-11■■■■■ 40.4
SND1Q7KZF4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.455e-11■■■■■ 40.4
SND1Q7KZF4 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.115e-11■■■■■ 40.4
SND1Q7KZF4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.975e-11■■■■■ 40.4
SND1Q7KZF4 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.645e-11■■■■■ 40.4
SND1Q7KZF4 IGFBP3-208ENST00000460477 574 ntTSL 217.47■□□□□ 0.395e-11■■■■■ 40.4
SND1Q7KZF4 IGFBP3-206ENST00000448817 571 ntTSL 412.8□□□□□ -0.365e-11■■■■■ 40.4
SND1Q7KZF4 SLC35F6-204ENST00000482746 528 ntTSL 219.4■□□□□ 0.74e-11■■■■■ 40.3
SND1Q7KZF4 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.688e-18■■■■■ 40.3
SND1Q7KZF4 GHDC-210ENST00000590249 561 ntTSL 416.11■□□□□ 0.171e-6■■■■■ 40.3
SND1Q7KZF4 CTSC-201ENST00000227266 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.563e-7■■■■■ 40.2
SND1Q7KZF4 PTMA-206ENST00000412128 863 ntTSL 325.3■■□□□ 1.647e-11■■■■■ 40.2
SND1Q7KZF4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.277e-11■■■■■ 40.2
SND1Q7KZF4 PTMA-212ENST00000481928 1635 ntTSL 317.48■□□□□ 0.397e-11■■■■■ 40.2
SND1Q7KZF4 PTMA-208ENST00000448874 1108 ntTSL 217.15■□□□□ 0.347e-11■■■■■ 40.2
SND1Q7KZF4 PTMA-210ENST00000467816 378 ntTSL 214.08□□□□□ -0.167e-11■■■■■ 40.2
SND1Q7KZF4 PTMA-211ENST00000468027 621 ntTSL 1 (best)13.37□□□□□ -0.277e-11■■■■■ 40.2
SND1Q7KZF4 SERPINA2-201ENST00000553483 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.547e-11■■■■■ 40.2
SND1Q7KZF4 PTMA-209ENST00000466801 784 ntTSL 511.42□□□□□ -0.587e-11■■■■■ 40.2
SND1Q7KZF4 PTMA-202ENST00000409115 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.587e-11■■■■■ 40.2
SND1Q7KZF4 PTMA-204ENST00000409683 933 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.637e-11■■■■■ 40.2
SND1Q7KZF4 PTMA-203ENST00000409321 735 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.687e-11■■■■■ 40.2
SND1Q7KZF4 PTMA-201ENST00000341369 1212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.757e-11■■■■■ 40.2
SND1Q7KZF4 PLOD3-213ENST00000478264 663 ntTSL 218.93■□□□□ 0.623e-11■■■■■ 40.1
SND1Q7KZF4 GHDC-208ENST00000588352 559 ntTSL 517.7■□□□□ 0.421e-6■■■■■ 40.1
SND1Q7KZF4 VWA1-202ENST00000471398 458 ntTSL 318.29■□□□□ 0.522e-9■■■■■ 40
SND1Q7KZF4 HPX-202ENST00000525057 760 ntTSL 511.33□□□□□ -0.69e-8■■■■■ 40
SND1Q7KZF4 FKBP2-205ENST00000536642 637 ntTSL 219.86■□□□□ 0.779e-9■■■■■ 40
SND1Q7KZF4 P4HA2-218ENST00000474628 743 ntTSL 28.08□□□□□ -1.121e-9■■■■■ 40
SND1Q7KZF4 C5orf15-201ENST00000231512 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.131e-10■■■■■ 39.9
SND1Q7KZF4 C5orf15-202ENST00000507191 635 ntTSL 212.11□□□□□ -0.471e-10■■■■■ 39.9
SND1Q7KZF4 PLOD3-216ENST00000489927 562 ntTSL 216.4■□□□□ 0.228e-15■■■■■ 39.9
SND1Q7KZF4 TFRC-214ENST00000483983 757 ntTSL 28.94□□□□□ -0.986e-12■■■■■ 39.9
SND1Q7KZF4 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.574e-10■■■■■ 39.8
SND1Q7KZF4 CTSL-206ENST00000495822 988 ntTSL 1 (best)15.35■□□□□ 0.054e-10■■■■■ 39.8
SND1Q7KZF4 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.054e-10■■■■■ 39.8
SND1Q7KZF4 CTSL-204ENST00000375894 975 ntTSL 314.12□□□□□ -0.154e-10■■■■■ 39.8
SND1Q7KZF4 BGN-204ENST00000480756 2278 ntTSL 515.11■□□□□ 0.012e-8■■■■■ 39.8
SND1Q7KZF4 BGN-203ENST00000472615 2225 ntTSL 513.56□□□□□ -0.242e-8■■■■■ 39.8
SND1Q7KZF4 BGN-201ENST00000331595 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.252e-8■■■■■ 39.8
SND1Q7KZF4 BGN-205ENST00000492658 420 ntTSL 310.39□□□□□ -0.752e-8■■■■■ 39.8
Retrieved 100 of 13,567 protein–RNA pairs in 45.6 ms