Protein–RNA interactions for Protein: Q7KZF4

SND1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 910 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SND1Q7KZF4 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.088e-12■■■■■ 71.4
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SND1Q7KZF4 ERP29-204ENST00000552052 284 ntTSL 310.98□□□□□ -0.652e-13■■■■■ 63.1
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SND1Q7KZF4 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.414e-28■■■■■ 53.3
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SND1Q7KZF4 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.224e-28■■■■■ 53.3
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SND1Q7KZF4 EMP3-205ENST00000597057 406 ntTSL 212.31□□□□□ -0.442e-12■■■■■ 53.2
SND1Q7KZF4 EMP3-202ENST00000593437 502 ntTSL 511.07□□□□□ -0.641e-9■■■■■ 53.2
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SND1Q7KZF4 EMP3-201ENST00000270221 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.71e-9■■■■■ 53.2
SND1Q7KZF4 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.121e-14■■■■■ 53
SND1Q7KZF4 BSG-213ENST00000613627 689 ntTSL 316.45■□□□□ 0.225e-28■■■■■ 52.9
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SND1Q7KZF4 VTN-203ENST00000542029 501 ntTSL 311.75□□□□□ -0.536e-18■■■■■ 52.6
SND1Q7KZF4 P4HA2-219ENST00000478055 929 ntTSL 210.03□□□□□ -0.81e-9■■■■■ 52.5
SND1Q7KZF4 P4HA2-208ENST00000416053 582 ntTSL 38.17□□□□□ -1.11e-9■■■■■ 52.5
SND1Q7KZF4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.194e-8■■■■■ 52.4
SND1Q7KZF4 A1BG-202ENST00000595014 2301 ntTSL 220.54■□□□□ 0.884e-8■■■■■ 52.4
SND1Q7KZF4 AC012313.3-201ENST00000600123 1765 ntTSL 1 (best)19.72■□□□□ 0.754e-8■■■■■ 52.4
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SND1Q7KZF4 NDUFA9-201ENST00000266544 8363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.913e-14■■■■■ 52.3
SND1Q7KZF4 AC005833.3-202ENST00000544741 770 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.183e-14■■■■■ 52.3
SND1Q7KZF4 FGB-204ENST00000497097 574 ntTSL 1 (best)11.97□□□□□ -0.493e-26■■■■■ 52.2
SND1Q7KZF4 FGB-202ENST00000425838 565 ntTSL 410.86□□□□□ -0.673e-26■■■■■ 52.2
SND1Q7KZF4 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.065e-83■■■■■ 52.2
SND1Q7KZF4 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.15e-83■■■■■ 52.2
SND1Q7KZF4 PRG2-203ENST00000530105 1048 ntTSL 513.16□□□□□ -0.35e-83■■■■■ 52.2
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