Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH9

PAMR1, Inactive serine protease PAMR1, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAMR1Q6UXH9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PAMR1Q6UXH9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PAMR1Q6UXH9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PAMR1Q6UXH9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PAMR1Q6UXH9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PAMR1Q6UXH9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PAMR1Q6UXH9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PAMR1Q6UXH9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PAMR1Q6UXH9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PAMR1Q6UXH9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PAMR1Q6UXH9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PAMR1Q6UXH9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAMR1Q6UXH9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAMR1Q6UXH9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAMR1Q6UXH9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAMR1Q6UXH9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAMR1Q6UXH9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAMR1Q6UXH9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PAMR1Q6UXH9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAMR1Q6UXH9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAMR1Q6UXH9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAMR1Q6UXH9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAMR1Q6UXH9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAMR1Q6UXH9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PAMR1Q6UXH9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PAMR1Q6UXH9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PAMR1Q6UXH9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PAMR1Q6UXH9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAMR1Q6UXH9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAMR1Q6UXH9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PAMR1Q6UXH9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PAMR1Q6UXH9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAMR1Q6UXH9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAMR1Q6UXH9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAMR1Q6UXH9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAMR1Q6UXH9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAMR1Q6UXH9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAMR1Q6UXH9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAMR1Q6UXH9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PAMR1Q6UXH9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAMR1Q6UXH9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAMR1Q6UXH9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAMR1Q6UXH9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAMR1Q6UXH9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PAMR1Q6UXH9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PAMR1Q6UXH9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PAMR1Q6UXH9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PAMR1Q6UXH9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PAMR1Q6UXH9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PAMR1Q6UXH9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PAMR1Q6UXH9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PAMR1Q6UXH9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PAMR1Q6UXH9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAMR1Q6UXH9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAMR1Q6UXH9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAMR1Q6UXH9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PAMR1Q6UXH9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PAMR1Q6UXH9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAMR1Q6UXH9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAMR1Q6UXH9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAMR1Q6UXH9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAMR1Q6UXH9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PAMR1Q6UXH9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PAMR1Q6UXH9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAMR1Q6UXH9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAMR1Q6UXH9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAMR1Q6UXH9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAMR1Q6UXH9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAMR1Q6UXH9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAMR1Q6UXH9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAMR1Q6UXH9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAMR1Q6UXH9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAMR1Q6UXH9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAMR1Q6UXH9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAMR1Q6UXH9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAMR1Q6UXH9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAMR1Q6UXH9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PAMR1Q6UXH9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAMR1Q6UXH9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAMR1Q6UXH9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PAMR1Q6UXH9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAMR1Q6UXH9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAMR1Q6UXH9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAMR1Q6UXH9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAMR1Q6UXH9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAMR1Q6UXH9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAMR1Q6UXH9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAMR1Q6UXH9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAMR1Q6UXH9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAMR1Q6UXH9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PAMR1Q6UXH9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PAMR1Q6UXH9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PAMR1Q6UXH9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PAMR1Q6UXH9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PAMR1Q6UXH9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PAMR1Q6UXH9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PAMR1Q6UXH9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAMR1Q6UXH9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAMR1Q6UXH9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAMR1Q6UXH9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms