Protein–RNA interactions for Protein: Q5TAB7

RIPPLY2, Protein ripply2, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY2Q5TAB7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIPPLY2Q5TAB7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIPPLY2Q5TAB7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIPPLY2Q5TAB7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIPPLY2Q5TAB7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIPPLY2Q5TAB7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RIPPLY2Q5TAB7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIPPLY2Q5TAB7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIPPLY2Q5TAB7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIPPLY2Q5TAB7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RIPPLY2Q5TAB7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIPPLY2Q5TAB7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RIPPLY2Q5TAB7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RIPPLY2Q5TAB7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIPPLY2Q5TAB7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIPPLY2Q5TAB7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIPPLY2Q5TAB7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIPPLY2Q5TAB7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIPPLY2Q5TAB7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIPPLY2Q5TAB7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIPPLY2Q5TAB7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIPPLY2Q5TAB7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIPPLY2Q5TAB7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RIPPLY2Q5TAB7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RIPPLY2Q5TAB7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RIPPLY2Q5TAB7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RIPPLY2Q5TAB7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIPPLY2Q5TAB7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIPPLY2Q5TAB7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RIPPLY2Q5TAB7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIPPLY2Q5TAB7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIPPLY2Q5TAB7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RIPPLY2Q5TAB7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RIPPLY2Q5TAB7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RIPPLY2Q5TAB7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RIPPLY2Q5TAB7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIPPLY2Q5TAB7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIPPLY2Q5TAB7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RIPPLY2Q5TAB7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIPPLY2Q5TAB7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIPPLY2Q5TAB7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIPPLY2Q5TAB7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIPPLY2Q5TAB7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIPPLY2Q5TAB7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIPPLY2Q5TAB7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIPPLY2Q5TAB7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIPPLY2Q5TAB7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIPPLY2Q5TAB7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIPPLY2Q5TAB7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIPPLY2Q5TAB7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIPPLY2Q5TAB7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIPPLY2Q5TAB7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIPPLY2Q5TAB7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIPPLY2Q5TAB7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RIPPLY2Q5TAB7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIPPLY2Q5TAB7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIPPLY2Q5TAB7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIPPLY2Q5TAB7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIPPLY2Q5TAB7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIPPLY2Q5TAB7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIPPLY2Q5TAB7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIPPLY2Q5TAB7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIPPLY2Q5TAB7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIPPLY2Q5TAB7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIPPLY2Q5TAB7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIPPLY2Q5TAB7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIPPLY2Q5TAB7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIPPLY2Q5TAB7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RIPPLY2Q5TAB7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIPPLY2Q5TAB7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RIPPLY2Q5TAB7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RIPPLY2Q5TAB7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RIPPLY2Q5TAB7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIPPLY2Q5TAB7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIPPLY2Q5TAB7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIPPLY2Q5TAB7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIPPLY2Q5TAB7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIPPLY2Q5TAB7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIPPLY2Q5TAB7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIPPLY2Q5TAB7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIPPLY2Q5TAB7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIPPLY2Q5TAB7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIPPLY2Q5TAB7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIPPLY2Q5TAB7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIPPLY2Q5TAB7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIPPLY2Q5TAB7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIPPLY2Q5TAB7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIPPLY2Q5TAB7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RIPPLY2Q5TAB7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIPPLY2Q5TAB7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIPPLY2Q5TAB7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIPPLY2Q5TAB7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIPPLY2Q5TAB7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RIPPLY2Q5TAB7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIPPLY2Q5TAB7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIPPLY2Q5TAB7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIPPLY2Q5TAB7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIPPLY2Q5TAB7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIPPLY2Q5TAB7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIPPLY2Q5TAB7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms