Protein–RNA interactions for Protein: Q2MJR0

SPRED3, Sprouty-related, EVH1 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRED3Q2MJR0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPRED3Q2MJR0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPRED3Q2MJR0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPRED3Q2MJR0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPRED3Q2MJR0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPRED3Q2MJR0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPRED3Q2MJR0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPRED3Q2MJR0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPRED3Q2MJR0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPRED3Q2MJR0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPRED3Q2MJR0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPRED3Q2MJR0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPRED3Q2MJR0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
SPRED3Q2MJR0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPRED3Q2MJR0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPRED3Q2MJR0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPRED3Q2MJR0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPRED3Q2MJR0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPRED3Q2MJR0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPRED3Q2MJR0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPRED3Q2MJR0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SPRED3Q2MJR0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SPRED3Q2MJR0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPRED3Q2MJR0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SPRED3Q2MJR0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SPRED3Q2MJR0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SPRED3Q2MJR0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPRED3Q2MJR0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPRED3Q2MJR0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPRED3Q2MJR0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SPRED3Q2MJR0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPRED3Q2MJR0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPRED3Q2MJR0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPRED3Q2MJR0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPRED3Q2MJR0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPRED3Q2MJR0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPRED3Q2MJR0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPRED3Q2MJR0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPRED3Q2MJR0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPRED3Q2MJR0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPRED3Q2MJR0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPRED3Q2MJR0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPRED3Q2MJR0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPRED3Q2MJR0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPRED3Q2MJR0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPRED3Q2MJR0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPRED3Q2MJR0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SPRED3Q2MJR0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
SPRED3Q2MJR0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPRED3Q2MJR0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPRED3Q2MJR0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPRED3Q2MJR0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPRED3Q2MJR0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPRED3Q2MJR0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPRED3Q2MJR0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPRED3Q2MJR0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPRED3Q2MJR0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPRED3Q2MJR0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPRED3Q2MJR0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SPRED3Q2MJR0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPRED3Q2MJR0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPRED3Q2MJR0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPRED3Q2MJR0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPRED3Q2MJR0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPRED3Q2MJR0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPRED3Q2MJR0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SPRED3Q2MJR0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPRED3Q2MJR0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPRED3Q2MJR0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPRED3Q2MJR0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPRED3Q2MJR0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPRED3Q2MJR0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPRED3Q2MJR0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPRED3Q2MJR0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPRED3Q2MJR0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPRED3Q2MJR0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPRED3Q2MJR0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPRED3Q2MJR0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPRED3Q2MJR0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPRED3Q2MJR0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPRED3Q2MJR0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPRED3Q2MJR0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPRED3Q2MJR0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPRED3Q2MJR0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPRED3Q2MJR0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPRED3Q2MJR0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SPRED3Q2MJR0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPRED3Q2MJR0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPRED3Q2MJR0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPRED3Q2MJR0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPRED3Q2MJR0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPRED3Q2MJR0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPRED3Q2MJR0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPRED3Q2MJR0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPRED3Q2MJR0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPRED3Q2MJR0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPRED3Q2MJR0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPRED3Q2MJR0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPRED3Q2MJR0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPRED3Q2MJR0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms