Protein–RNA interactions for Protein: Q15652

JMJD1C, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 2,540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD1CQ15652 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
JMJD1CQ15652 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
JMJD1CQ15652 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
JMJD1CQ15652 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
JMJD1CQ15652 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
JMJD1CQ15652 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
JMJD1CQ15652 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
JMJD1CQ15652 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
JMJD1CQ15652 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
JMJD1CQ15652 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
JMJD1CQ15652 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
JMJD1CQ15652 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
JMJD1CQ15652 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
JMJD1CQ15652 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
JMJD1CQ15652 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
JMJD1CQ15652 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
JMJD1CQ15652 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
JMJD1CQ15652 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
JMJD1CQ15652 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
JMJD1CQ15652 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
JMJD1CQ15652 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
JMJD1CQ15652 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
JMJD1CQ15652 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
JMJD1CQ15652 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
JMJD1CQ15652 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
JMJD1CQ15652 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
JMJD1CQ15652 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
JMJD1CQ15652 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
JMJD1CQ15652 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
JMJD1CQ15652 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
JMJD1CQ15652 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
JMJD1CQ15652 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
JMJD1CQ15652 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
JMJD1CQ15652 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
JMJD1CQ15652 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
JMJD1CQ15652 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
JMJD1CQ15652 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
JMJD1CQ15652 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
JMJD1CQ15652 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
JMJD1CQ15652 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
JMJD1CQ15652 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
JMJD1CQ15652 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
JMJD1CQ15652 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
JMJD1CQ15652 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
JMJD1CQ15652 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
JMJD1CQ15652 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
JMJD1CQ15652 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
JMJD1CQ15652 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
JMJD1CQ15652 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
JMJD1CQ15652 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
JMJD1CQ15652 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
JMJD1CQ15652 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
JMJD1CQ15652 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
JMJD1CQ15652 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
JMJD1CQ15652 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
JMJD1CQ15652 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
JMJD1CQ15652 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
JMJD1CQ15652 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
JMJD1CQ15652 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
JMJD1CQ15652 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
JMJD1CQ15652 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
JMJD1CQ15652 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
JMJD1CQ15652 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
JMJD1CQ15652 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
JMJD1CQ15652 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
JMJD1CQ15652 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
JMJD1CQ15652 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
JMJD1CQ15652 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
JMJD1CQ15652 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
JMJD1CQ15652 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
JMJD1CQ15652 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
JMJD1CQ15652 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
JMJD1CQ15652 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
JMJD1CQ15652 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
JMJD1CQ15652 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
JMJD1CQ15652 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
JMJD1CQ15652 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
JMJD1CQ15652 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
JMJD1CQ15652 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
JMJD1CQ15652 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
JMJD1CQ15652 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
JMJD1CQ15652 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
JMJD1CQ15652 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
JMJD1CQ15652 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
JMJD1CQ15652 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
JMJD1CQ15652 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
JMJD1CQ15652 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
JMJD1CQ15652 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
JMJD1CQ15652 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
JMJD1CQ15652 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
JMJD1CQ15652 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
JMJD1CQ15652 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
JMJD1CQ15652 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
JMJD1CQ15652 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
JMJD1CQ15652 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
JMJD1CQ15652 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
JMJD1CQ15652 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
JMJD1CQ15652 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
JMJD1CQ15652 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
JMJD1CQ15652 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms