Protein–RNA interactions for Protein: Q06587

RING1, E3 ubiquitin-protein ligase RING1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RING1Q06587 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RING1Q06587 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RING1Q06587 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
RING1Q06587 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RING1Q06587 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RING1Q06587 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RING1Q06587 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RING1Q06587 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RING1Q06587 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RING1Q06587 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RING1Q06587 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RING1Q06587 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RING1Q06587 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RING1Q06587 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RING1Q06587 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RING1Q06587 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RING1Q06587 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RING1Q06587 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RING1Q06587 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RING1Q06587 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RING1Q06587 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RING1Q06587 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RING1Q06587 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RING1Q06587 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RING1Q06587 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RING1Q06587 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RING1Q06587 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RING1Q06587 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RING1Q06587 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RING1Q06587 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RING1Q06587 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
RING1Q06587 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RING1Q06587 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RING1Q06587 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RING1Q06587 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RING1Q06587 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
RING1Q06587 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RING1Q06587 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RING1Q06587 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RING1Q06587 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RING1Q06587 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RING1Q06587 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RING1Q06587 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RING1Q06587 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RING1Q06587 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RING1Q06587 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RING1Q06587 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RING1Q06587 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RING1Q06587 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RING1Q06587 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RING1Q06587 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RING1Q06587 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RING1Q06587 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RING1Q06587 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RING1Q06587 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RING1Q06587 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RING1Q06587 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RING1Q06587 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RING1Q06587 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RING1Q06587 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RING1Q06587 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RING1Q06587 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RING1Q06587 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RING1Q06587 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RING1Q06587 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RING1Q06587 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RING1Q06587 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RING1Q06587 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RING1Q06587 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RING1Q06587 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RING1Q06587 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RING1Q06587 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RING1Q06587 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RING1Q06587 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RING1Q06587 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
RING1Q06587 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RING1Q06587 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RING1Q06587 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RING1Q06587 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RING1Q06587 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RING1Q06587 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RING1Q06587 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RING1Q06587 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RING1Q06587 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RING1Q06587 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RING1Q06587 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RING1Q06587 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RING1Q06587 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
RING1Q06587 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RING1Q06587 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RING1Q06587 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RING1Q06587 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RING1Q06587 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
RING1Q06587 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RING1Q06587 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RING1Q06587 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RING1Q06587 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RING1Q06587 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RING1Q06587 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RING1Q06587 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms