Protein–RNA interactions for Protein: Q03167

TGFBR3, Transforming growth factor beta receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR3Q03167 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TGFBR3Q03167 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TGFBR3Q03167 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TGFBR3Q03167 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TGFBR3Q03167 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TGFBR3Q03167 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TGFBR3Q03167 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TGFBR3Q03167 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TGFBR3Q03167 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TGFBR3Q03167 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TGFBR3Q03167 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TGFBR3Q03167 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TGFBR3Q03167 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TGFBR3Q03167 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TGFBR3Q03167 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TGFBR3Q03167 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TGFBR3Q03167 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TGFBR3Q03167 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TGFBR3Q03167 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TGFBR3Q03167 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TGFBR3Q03167 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TGFBR3Q03167 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TGFBR3Q03167 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TGFBR3Q03167 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TGFBR3Q03167 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TGFBR3Q03167 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TGFBR3Q03167 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TGFBR3Q03167 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TGFBR3Q03167 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TGFBR3Q03167 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TGFBR3Q03167 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TGFBR3Q03167 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TGFBR3Q03167 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TGFBR3Q03167 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TGFBR3Q03167 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TGFBR3Q03167 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TGFBR3Q03167 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TGFBR3Q03167 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TGFBR3Q03167 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TGFBR3Q03167 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TGFBR3Q03167 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TGFBR3Q03167 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TGFBR3Q03167 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TGFBR3Q03167 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TGFBR3Q03167 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TGFBR3Q03167 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TGFBR3Q03167 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TGFBR3Q03167 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TGFBR3Q03167 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TGFBR3Q03167 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TGFBR3Q03167 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TGFBR3Q03167 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TGFBR3Q03167 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TGFBR3Q03167 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TGFBR3Q03167 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TGFBR3Q03167 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TGFBR3Q03167 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TGFBR3Q03167 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TGFBR3Q03167 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TGFBR3Q03167 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TGFBR3Q03167 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TGFBR3Q03167 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TGFBR3Q03167 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TGFBR3Q03167 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TGFBR3Q03167 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TGFBR3Q03167 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TGFBR3Q03167 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TGFBR3Q03167 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TGFBR3Q03167 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TGFBR3Q03167 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TGFBR3Q03167 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TGFBR3Q03167 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TGFBR3Q03167 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TGFBR3Q03167 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TGFBR3Q03167 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TGFBR3Q03167 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TGFBR3Q03167 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TGFBR3Q03167 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TGFBR3Q03167 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TGFBR3Q03167 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TGFBR3Q03167 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TGFBR3Q03167 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TGFBR3Q03167 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TGFBR3Q03167 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TGFBR3Q03167 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TGFBR3Q03167 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TGFBR3Q03167 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TGFBR3Q03167 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TGFBR3Q03167 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TGFBR3Q03167 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TGFBR3Q03167 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TGFBR3Q03167 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TGFBR3Q03167 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TGFBR3Q03167 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TGFBR3Q03167 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TGFBR3Q03167 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TGFBR3Q03167 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TGFBR3Q03167 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TGFBR3Q03167 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TGFBR3Q03167 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms