Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPEQ02224 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPEQ02224 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPEQ02224 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPEQ02224 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPEQ02224 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPEQ02224 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPEQ02224 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPEQ02224 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPEQ02224 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPEQ02224 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPEQ02224 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPEQ02224 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPEQ02224 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPEQ02224 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPEQ02224 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPEQ02224 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPEQ02224 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPEQ02224 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPEQ02224 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPEQ02224 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPEQ02224 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CENPEQ02224 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CENPEQ02224 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPEQ02224 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPEQ02224 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPEQ02224 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPEQ02224 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPEQ02224 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPEQ02224 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPEQ02224 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPEQ02224 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPEQ02224 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPEQ02224 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPEQ02224 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPEQ02224 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPEQ02224 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPEQ02224 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPEQ02224 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CENPEQ02224 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CENPEQ02224 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CENPEQ02224 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CENPEQ02224 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CENPEQ02224 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CENPEQ02224 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CENPEQ02224 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CENPEQ02224 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CENPEQ02224 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CENPEQ02224 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CENPEQ02224 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CENPEQ02224 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CENPEQ02224 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CENPEQ02224 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CENPEQ02224 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CENPEQ02224 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CENPEQ02224 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CENPEQ02224 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CENPEQ02224 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CENPEQ02224 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CENPEQ02224 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CENPEQ02224 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CENPEQ02224 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CENPEQ02224 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CENPEQ02224 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CENPEQ02224 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CENPEQ02224 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CENPEQ02224 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CENPEQ02224 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CENPEQ02224 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CENPEQ02224 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPEQ02224 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPEQ02224 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPEQ02224 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPEQ02224 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPEQ02224 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPEQ02224 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPEQ02224 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPEQ02224 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CENPEQ02224 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPEQ02224 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPEQ02224 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPEQ02224 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPEQ02224 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPEQ02224 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPEQ02224 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPEQ02224 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPEQ02224 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPEQ02224 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPEQ02224 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPEQ02224 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CENPEQ02224 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPEQ02224 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPEQ02224 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPEQ02224 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPEQ02224 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPEQ02224 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPEQ02224 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPEQ02224 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPEQ02224 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPEQ02224 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms