Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SKP1P63208 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SKP1P63208 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SKP1P63208 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SKP1P63208 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SKP1P63208 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SKP1P63208 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SKP1P63208 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SKP1P63208 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SKP1P63208 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SKP1P63208 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SKP1P63208 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SKP1P63208 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SKP1P63208 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SKP1P63208 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SKP1P63208 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SKP1P63208 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SKP1P63208 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SKP1P63208 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SKP1P63208 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SKP1P63208 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SKP1P63208 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SKP1P63208 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SKP1P63208 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SKP1P63208 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SKP1P63208 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SKP1P63208 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SKP1P63208 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SKP1P63208 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SKP1P63208 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SKP1P63208 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SKP1P63208 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SKP1P63208 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SKP1P63208 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SKP1P63208 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SKP1P63208 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SKP1P63208 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SKP1P63208 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SKP1P63208 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SKP1P63208 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SKP1P63208 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SKP1P63208 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SKP1P63208 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SKP1P63208 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SKP1P63208 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SKP1P63208 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SKP1P63208 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SKP1P63208 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SKP1P63208 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SKP1P63208 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SKP1P63208 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SKP1P63208 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SKP1P63208 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SKP1P63208 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SKP1P63208 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SKP1P63208 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SKP1P63208 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SKP1P63208 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SKP1P63208 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SKP1P63208 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SKP1P63208 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SKP1P63208 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SKP1P63208 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SKP1P63208 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SKP1P63208 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SKP1P63208 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SKP1P63208 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SKP1P63208 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SKP1P63208 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SKP1P63208 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SKP1P63208 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SKP1P63208 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SKP1P63208 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SKP1P63208 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SKP1P63208 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SKP1P63208 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SKP1P63208 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SKP1P63208 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SKP1P63208 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SKP1P63208 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SKP1P63208 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SKP1P63208 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SKP1P63208 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SKP1P63208 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SKP1P63208 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SKP1P63208 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SKP1P63208 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SKP1P63208 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SKP1P63208 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SKP1P63208 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SKP1P63208 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SKP1P63208 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SKP1P63208 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SKP1P63208 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SKP1P63208 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SKP1P63208 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SKP1P63208 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SKP1P63208 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SKP1P63208 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SKP1P63208 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms