Protein–RNA interactions for Protein: P62310

LSM3, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM3P62310 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LSM3P62310 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LSM3P62310 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LSM3P62310 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LSM3P62310 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LSM3P62310 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LSM3P62310 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LSM3P62310 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LSM3P62310 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LSM3P62310 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LSM3P62310 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LSM3P62310 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LSM3P62310 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LSM3P62310 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LSM3P62310 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LSM3P62310 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LSM3P62310 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LSM3P62310 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LSM3P62310 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LSM3P62310 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LSM3P62310 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LSM3P62310 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LSM3P62310 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LSM3P62310 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LSM3P62310 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LSM3P62310 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LSM3P62310 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LSM3P62310 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LSM3P62310 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LSM3P62310 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LSM3P62310 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LSM3P62310 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LSM3P62310 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LSM3P62310 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LSM3P62310 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LSM3P62310 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LSM3P62310 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LSM3P62310 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LSM3P62310 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LSM3P62310 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LSM3P62310 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LSM3P62310 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LSM3P62310 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LSM3P62310 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LSM3P62310 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LSM3P62310 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LSM3P62310 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LSM3P62310 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LSM3P62310 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LSM3P62310 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LSM3P62310 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LSM3P62310 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LSM3P62310 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LSM3P62310 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LSM3P62310 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LSM3P62310 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LSM3P62310 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LSM3P62310 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LSM3P62310 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LSM3P62310 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LSM3P62310 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LSM3P62310 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LSM3P62310 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LSM3P62310 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LSM3P62310 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LSM3P62310 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LSM3P62310 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LSM3P62310 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LSM3P62310 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LSM3P62310 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LSM3P62310 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LSM3P62310 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LSM3P62310 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LSM3P62310 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LSM3P62310 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LSM3P62310 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LSM3P62310 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LSM3P62310 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LSM3P62310 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LSM3P62310 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LSM3P62310 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LSM3P62310 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LSM3P62310 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LSM3P62310 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LSM3P62310 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
LSM3P62310 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LSM3P62310 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LSM3P62310 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LSM3P62310 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LSM3P62310 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LSM3P62310 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LSM3P62310 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LSM3P62310 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSM3P62310 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSM3P62310 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LSM3P62310 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LSM3P62310 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LSM3P62310 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LSM3P62310 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LSM3P62310 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms