Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB5CP51148 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB5CP51148 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB5CP51148 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RAB5CP51148 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB5CP51148 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB5CP51148 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB5CP51148 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB5CP51148 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB5CP51148 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB5CP51148 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB5CP51148 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB5CP51148 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB5CP51148 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB5CP51148 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB5CP51148 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB5CP51148 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB5CP51148 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB5CP51148 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB5CP51148 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB5CP51148 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB5CP51148 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB5CP51148 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB5CP51148 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB5CP51148 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB5CP51148 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB5CP51148 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB5CP51148 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB5CP51148 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB5CP51148 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB5CP51148 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB5CP51148 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB5CP51148 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB5CP51148 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB5CP51148 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB5CP51148 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB5CP51148 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB5CP51148 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB5CP51148 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB5CP51148 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB5CP51148 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB5CP51148 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB5CP51148 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB5CP51148 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB5CP51148 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB5CP51148 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB5CP51148 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB5CP51148 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB5CP51148 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB5CP51148 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB5CP51148 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB5CP51148 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB5CP51148 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB5CP51148 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB5CP51148 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB5CP51148 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB5CP51148 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB5CP51148 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB5CP51148 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB5CP51148 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB5CP51148 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB5CP51148 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB5CP51148 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB5CP51148 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB5CP51148 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB5CP51148 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB5CP51148 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB5CP51148 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB5CP51148 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB5CP51148 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB5CP51148 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB5CP51148 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB5CP51148 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RAB5CP51148 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB5CP51148 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB5CP51148 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB5CP51148 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB5CP51148 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB5CP51148 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB5CP51148 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB5CP51148 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB5CP51148 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB5CP51148 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB5CP51148 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB5CP51148 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB5CP51148 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB5CP51148 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB5CP51148 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB5CP51148 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB5CP51148 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB5CP51148 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB5CP51148 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB5CP51148 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB5CP51148 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB5CP51148 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB5CP51148 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB5CP51148 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB5CP51148 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB5CP51148 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB5CP51148 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms