Protein–RNA interactions for Protein: P48539

PCP4, Calmodulin regulator protein PCP4, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCP4P48539 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCP4P48539 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCP4P48539 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCP4P48539 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCP4P48539 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCP4P48539 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PCP4P48539 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PCP4P48539 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCP4P48539 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCP4P48539 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PCP4P48539 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PCP4P48539 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PCP4P48539 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PCP4P48539 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PCP4P48539 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PCP4P48539 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PCP4P48539 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PCP4P48539 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PCP4P48539 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PCP4P48539 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PCP4P48539 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PCP4P48539 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PCP4P48539 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCP4P48539 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCP4P48539 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCP4P48539 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCP4P48539 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCP4P48539 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCP4P48539 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCP4P48539 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCP4P48539 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCP4P48539 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCP4P48539 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCP4P48539 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCP4P48539 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCP4P48539 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCP4P48539 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCP4P48539 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCP4P48539 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCP4P48539 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCP4P48539 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCP4P48539 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCP4P48539 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCP4P48539 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCP4P48539 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PCP4P48539 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCP4P48539 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCP4P48539 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCP4P48539 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCP4P48539 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCP4P48539 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCP4P48539 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCP4P48539 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCP4P48539 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCP4P48539 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCP4P48539 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCP4P48539 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCP4P48539 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCP4P48539 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCP4P48539 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCP4P48539 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PCP4P48539 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PCP4P48539 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PCP4P48539 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PCP4P48539 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PCP4P48539 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PCP4P48539 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PCP4P48539 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PCP4P48539 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PCP4P48539 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PCP4P48539 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PCP4P48539 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PCP4P48539 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PCP4P48539 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCP4P48539 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCP4P48539 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PCP4P48539 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCP4P48539 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCP4P48539 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCP4P48539 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCP4P48539 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PCP4P48539 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PCP4P48539 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PCP4P48539 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCP4P48539 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCP4P48539 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCP4P48539 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCP4P48539 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCP4P48539 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCP4P48539 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCP4P48539 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCP4P48539 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCP4P48539 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCP4P48539 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCP4P48539 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCP4P48539 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PCP4P48539 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PCP4P48539 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PCP4P48539 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PCP4P48539 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms