Protein–RNA interactions for Protein: P43116

PTGER2, Prostaglandin E2 receptor EP2 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER2P43116 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
PTGER2P43116 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
PTGER2P43116 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
PTGER2P43116 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
PTGER2P43116 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
PTGER2P43116 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
PTGER2P43116 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
PTGER2P43116 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC35.31■■■■□ 3.24
PTGER2P43116 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
PTGER2P43116 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PTGER2P43116 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
PTGER2P43116 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PTGER2P43116 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PTGER2P43116 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
PTGER2P43116 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
PTGER2P43116 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
PTGER2P43116 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
PTGER2P43116 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC35.21■■■■□ 3.23
PTGER2P43116 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PTGER2P43116 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
PTGER2P43116 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
PTGER2P43116 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
PTGER2P43116 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
PTGER2P43116 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PTGER2P43116 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
PTGER2P43116 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
PTGER2P43116 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
PTGER2P43116 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
PTGER2P43116 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
PTGER2P43116 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
PTGER2P43116 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
PTGER2P43116 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
PTGER2P43116 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
PTGER2P43116 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
PTGER2P43116 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
PTGER2P43116 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
PTGER2P43116 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
PTGER2P43116 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
PTGER2P43116 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
PTGER2P43116 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
PTGER2P43116 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
PTGER2P43116 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
PTGER2P43116 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
PTGER2P43116 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
PTGER2P43116 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
PTGER2P43116 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
PTGER2P43116 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
PTGER2P43116 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
PTGER2P43116 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PTGER2P43116 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
PTGER2P43116 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
PTGER2P43116 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
PTGER2P43116 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
PTGER2P43116 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
PTGER2P43116 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
PTGER2P43116 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
PTGER2P43116 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC34.89■■■■□ 3.18
PTGER2P43116 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
PTGER2P43116 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
PTGER2P43116 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
PTGER2P43116 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
PTGER2P43116 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
PTGER2P43116 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
PTGER2P43116 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
PTGER2P43116 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
PTGER2P43116 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
PTGER2P43116 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
PTGER2P43116 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
PTGER2P43116 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
PTGER2P43116 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
PTGER2P43116 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PTGER2P43116 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PTGER2P43116 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
PTGER2P43116 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
PTGER2P43116 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
PTGER2P43116 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
PTGER2P43116 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
PTGER2P43116 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
PTGER2P43116 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
PTGER2P43116 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
PTGER2P43116 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
PTGER2P43116 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
PTGER2P43116 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
PTGER2P43116 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
PTGER2P43116 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PTGER2P43116 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
PTGER2P43116 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
PTGER2P43116 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
PTGER2P43116 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
PTGER2P43116 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PTGER2P43116 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PTGER2P43116 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
PTGER2P43116 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PTGER2P43116 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
PTGER2P43116 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
PTGER2P43116 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PTGER2P43116 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PTGER2P43116 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PTGER2P43116 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
PTGER2P43116 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms