Protein–RNA interactions for Protein: P35680

HNF1B, Hepatocyte nuclear factor 1-beta, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF1BP35680 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HNF1BP35680 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
HNF1BP35680 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HNF1BP35680 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HNF1BP35680 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HNF1BP35680 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
HNF1BP35680 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HNF1BP35680 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HNF1BP35680 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HNF1BP35680 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
HNF1BP35680 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HNF1BP35680 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HNF1BP35680 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HNF1BP35680 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
HNF1BP35680 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HNF1BP35680 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HNF1BP35680 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HNF1BP35680 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
HNF1BP35680 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HNF1BP35680 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HNF1BP35680 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HNF1BP35680 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HNF1BP35680 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HNF1BP35680 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HNF1BP35680 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
HNF1BP35680 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HNF1BP35680 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HNF1BP35680 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HNF1BP35680 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HNF1BP35680 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HNF1BP35680 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HNF1BP35680 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HNF1BP35680 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HNF1BP35680 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HNF1BP35680 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HNF1BP35680 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HNF1BP35680 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HNF1BP35680 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HNF1BP35680 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HNF1BP35680 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HNF1BP35680 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HNF1BP35680 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HNF1BP35680 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HNF1BP35680 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HNF1BP35680 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HNF1BP35680 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HNF1BP35680 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HNF1BP35680 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HNF1BP35680 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HNF1BP35680 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HNF1BP35680 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
HNF1BP35680 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HNF1BP35680 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HNF1BP35680 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HNF1BP35680 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HNF1BP35680 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HNF1BP35680 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HNF1BP35680 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HNF1BP35680 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HNF1BP35680 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HNF1BP35680 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HNF1BP35680 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
HNF1BP35680 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HNF1BP35680 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HNF1BP35680 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HNF1BP35680 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HNF1BP35680 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HNF1BP35680 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HNF1BP35680 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HNF1BP35680 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HNF1BP35680 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HNF1BP35680 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
HNF1BP35680 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HNF1BP35680 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HNF1BP35680 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HNF1BP35680 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
HNF1BP35680 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HNF1BP35680 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HNF1BP35680 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HNF1BP35680 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HNF1BP35680 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HNF1BP35680 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HNF1BP35680 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HNF1BP35680 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HNF1BP35680 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HNF1BP35680 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HNF1BP35680 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HNF1BP35680 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HNF1BP35680 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
HNF1BP35680 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HNF1BP35680 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HNF1BP35680 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
HNF1BP35680 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HNF1BP35680 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HNF1BP35680 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HNF1BP35680 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HNF1BP35680 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HNF1BP35680 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HNF1BP35680 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HNF1BP35680 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms