Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TNNT1P13805 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TNNT1P13805 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TNNT1P13805 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TNNT1P13805 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TNNT1P13805 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TNNT1P13805 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TNNT1P13805 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TNNT1P13805 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TNNT1P13805 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TNNT1P13805 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TNNT1P13805 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TNNT1P13805 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TNNT1P13805 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TNNT1P13805 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TNNT1P13805 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TNNT1P13805 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TNNT1P13805 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TNNT1P13805 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TNNT1P13805 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TNNT1P13805 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TNNT1P13805 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TNNT1P13805 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TNNT1P13805 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TNNT1P13805 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TNNT1P13805 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TNNT1P13805 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TNNT1P13805 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TNNT1P13805 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TNNT1P13805 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TNNT1P13805 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TNNT1P13805 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TNNT1P13805 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
TNNT1P13805 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TNNT1P13805 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TNNT1P13805 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TNNT1P13805 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TNNT1P13805 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TNNT1P13805 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
TNNT1P13805 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TNNT1P13805 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TNNT1P13805 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TNNT1P13805 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TNNT1P13805 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
TNNT1P13805 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TNNT1P13805 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TNNT1P13805 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TNNT1P13805 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TNNT1P13805 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNNT1P13805 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TNNT1P13805 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TNNT1P13805 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TNNT1P13805 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TNNT1P13805 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TNNT1P13805 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNNT1P13805 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TNNT1P13805 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNNT1P13805 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNNT1P13805 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNNT1P13805 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNNT1P13805 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNNT1P13805 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
TNNT1P13805 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNNT1P13805 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TNNT1P13805 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TNNT1P13805 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNNT1P13805 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
TNNT1P13805 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNNT1P13805 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNNT1P13805 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNNT1P13805 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNNT1P13805 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNNT1P13805 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNNT1P13805 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNNT1P13805 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNNT1P13805 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNNT1P13805 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNNT1P13805 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNNT1P13805 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNNT1P13805 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNNT1P13805 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNNT1P13805 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNNT1P13805 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNNT1P13805 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNNT1P13805 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNNT1P13805 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNNT1P13805 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TNNT1P13805 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TNNT1P13805 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TNNT1P13805 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNNT1P13805 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNNT1P13805 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNNT1P13805 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNNT1P13805 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNNT1P13805 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TNNT1P13805 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TNNT1P13805 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TNNT1P13805 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
TNNT1P13805 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TNNT1P13805 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.8 ms