Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TPRP12270 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TPRP12270 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TPRP12270 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TPRP12270 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TPRP12270 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TPRP12270 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TPRP12270 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TPRP12270 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TPRP12270 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TPRP12270 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TPRP12270 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TPRP12270 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TPRP12270 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TPRP12270 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TPRP12270 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TPRP12270 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TPRP12270 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TPRP12270 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TPRP12270 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TPRP12270 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TPRP12270 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
TPRP12270 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TPRP12270 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TPRP12270 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TPRP12270 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TPRP12270 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TPRP12270 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TPRP12270 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TPRP12270 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TPRP12270 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TPRP12270 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TPRP12270 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TPRP12270 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TPRP12270 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TPRP12270 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TPRP12270 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TPRP12270 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TPRP12270 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TPRP12270 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TPRP12270 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TPRP12270 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TPRP12270 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TPRP12270 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TPRP12270 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TPRP12270 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TPRP12270 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TPRP12270 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TPRP12270 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TPRP12270 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TPRP12270 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TPRP12270 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TPRP12270 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TPRP12270 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TPRP12270 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TPRP12270 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TPRP12270 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TPRP12270 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TPRP12270 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TPRP12270 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TPRP12270 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TPRP12270 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TPRP12270 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TPRP12270 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TPRP12270 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TPRP12270 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TPRP12270 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TPRP12270 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TPRP12270 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TPRP12270 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TPRP12270 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TPRP12270 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TPRP12270 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TPRP12270 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TPRP12270 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TPRP12270 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TPRP12270 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TPRP12270 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TPRP12270 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TPRP12270 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TPRP12270 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TPRP12270 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TPRP12270 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TPRP12270 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TPRP12270 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TPRP12270 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TPRP12270 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TPRP12270 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TPRP12270 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TPRP12270 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TPRP12270 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TPRP12270 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TPRP12270 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TPRP12270 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TPRP12270 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TPRP12270 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TPRP12270 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TPRP12270 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TPRP12270 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TPRP12270 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms