Protein–RNA interactions for Protein: P0DME0

SETSIP, Protein SETSIP, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETSIPP0DME0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SETSIPP0DME0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SETSIPP0DME0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SETSIPP0DME0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SETSIPP0DME0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SETSIPP0DME0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SETSIPP0DME0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SETSIPP0DME0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SETSIPP0DME0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SETSIPP0DME0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SETSIPP0DME0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SETSIPP0DME0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SETSIPP0DME0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SETSIPP0DME0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SETSIPP0DME0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SETSIPP0DME0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
SETSIPP0DME0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SETSIPP0DME0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SETSIPP0DME0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SETSIPP0DME0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SETSIPP0DME0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SETSIPP0DME0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SETSIPP0DME0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SETSIPP0DME0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SETSIPP0DME0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SETSIPP0DME0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SETSIPP0DME0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SETSIPP0DME0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SETSIPP0DME0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SETSIPP0DME0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SETSIPP0DME0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SETSIPP0DME0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SETSIPP0DME0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SETSIPP0DME0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SETSIPP0DME0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SETSIPP0DME0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SETSIPP0DME0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SETSIPP0DME0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SETSIPP0DME0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SETSIPP0DME0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SETSIPP0DME0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SETSIPP0DME0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SETSIPP0DME0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SETSIPP0DME0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SETSIPP0DME0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SETSIPP0DME0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SETSIPP0DME0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SETSIPP0DME0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SETSIPP0DME0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SETSIPP0DME0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SETSIPP0DME0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SETSIPP0DME0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SETSIPP0DME0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SETSIPP0DME0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SETSIPP0DME0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SETSIPP0DME0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SETSIPP0DME0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SETSIPP0DME0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SETSIPP0DME0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SETSIPP0DME0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SETSIPP0DME0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SETSIPP0DME0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SETSIPP0DME0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SETSIPP0DME0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SETSIPP0DME0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SETSIPP0DME0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SETSIPP0DME0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SETSIPP0DME0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SETSIPP0DME0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SETSIPP0DME0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SETSIPP0DME0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SETSIPP0DME0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SETSIPP0DME0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SETSIPP0DME0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SETSIPP0DME0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SETSIPP0DME0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SETSIPP0DME0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SETSIPP0DME0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SETSIPP0DME0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SETSIPP0DME0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SETSIPP0DME0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SETSIPP0DME0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SETSIPP0DME0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SETSIPP0DME0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SETSIPP0DME0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SETSIPP0DME0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SETSIPP0DME0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SETSIPP0DME0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SETSIPP0DME0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SETSIPP0DME0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SETSIPP0DME0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SETSIPP0DME0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SETSIPP0DME0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SETSIPP0DME0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SETSIPP0DME0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SETSIPP0DME0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SETSIPP0DME0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SETSIPP0DME0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SETSIPP0DME0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SETSIPP0DME0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms