Protein–RNA interactions for Protein: P0CB38

PABPC4L, Polyadenylate-binding protein 4-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4LP0CB38 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PABPC4LP0CB38 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PABPC4LP0CB38 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PABPC4LP0CB38 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PABPC4LP0CB38 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PABPC4LP0CB38 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PABPC4LP0CB38 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PABPC4LP0CB38 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PABPC4LP0CB38 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PABPC4LP0CB38 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PABPC4LP0CB38 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PABPC4LP0CB38 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PABPC4LP0CB38 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PABPC4LP0CB38 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PABPC4LP0CB38 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PABPC4LP0CB38 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PABPC4LP0CB38 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PABPC4LP0CB38 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PABPC4LP0CB38 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PABPC4LP0CB38 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PABPC4LP0CB38 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PABPC4LP0CB38 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PABPC4LP0CB38 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PABPC4LP0CB38 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PABPC4LP0CB38 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PABPC4LP0CB38 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PABPC4LP0CB38 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PABPC4LP0CB38 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PABPC4LP0CB38 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PABPC4LP0CB38 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PABPC4LP0CB38 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PABPC4LP0CB38 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PABPC4LP0CB38 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PABPC4LP0CB38 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PABPC4LP0CB38 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PABPC4LP0CB38 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PABPC4LP0CB38 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PABPC4LP0CB38 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PABPC4LP0CB38 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PABPC4LP0CB38 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PABPC4LP0CB38 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PABPC4LP0CB38 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PABPC4LP0CB38 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PABPC4LP0CB38 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PABPC4LP0CB38 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PABPC4LP0CB38 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PABPC4LP0CB38 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PABPC4LP0CB38 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PABPC4LP0CB38 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PABPC4LP0CB38 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PABPC4LP0CB38 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PABPC4LP0CB38 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PABPC4LP0CB38 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PABPC4LP0CB38 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PABPC4LP0CB38 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PABPC4LP0CB38 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PABPC4LP0CB38 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PABPC4LP0CB38 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PABPC4LP0CB38 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PABPC4LP0CB38 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PABPC4LP0CB38 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PABPC4LP0CB38 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PABPC4LP0CB38 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PABPC4LP0CB38 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PABPC4LP0CB38 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PABPC4LP0CB38 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PABPC4LP0CB38 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PABPC4LP0CB38 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PABPC4LP0CB38 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PABPC4LP0CB38 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PABPC4LP0CB38 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PABPC4LP0CB38 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PABPC4LP0CB38 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PABPC4LP0CB38 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PABPC4LP0CB38 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PABPC4LP0CB38 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PABPC4LP0CB38 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PABPC4LP0CB38 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PABPC4LP0CB38 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PABPC4LP0CB38 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PABPC4LP0CB38 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PABPC4LP0CB38 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PABPC4LP0CB38 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PABPC4LP0CB38 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PABPC4LP0CB38 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PABPC4LP0CB38 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PABPC4LP0CB38 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PABPC4LP0CB38 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PABPC4LP0CB38 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PABPC4LP0CB38 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PABPC4LP0CB38 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PABPC4LP0CB38 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PABPC4LP0CB38 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PABPC4LP0CB38 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PABPC4LP0CB38 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PABPC4LP0CB38 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PABPC4LP0CB38 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PABPC4LP0CB38 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PABPC4LP0CB38 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PABPC4LP0CB38 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms