Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TPM2P07951 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TPM2P07951 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TPM2P07951 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TPM2P07951 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TPM2P07951 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TPM2P07951 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
TPM2P07951 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
TPM2P07951 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
TPM2P07951 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TPM2P07951 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TPM2P07951 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TPM2P07951 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TPM2P07951 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TPM2P07951 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TPM2P07951 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TPM2P07951 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TPM2P07951 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TPM2P07951 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TPM2P07951 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TPM2P07951 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TPM2P07951 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TPM2P07951 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TPM2P07951 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
TPM2P07951 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TPM2P07951 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TPM2P07951 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TPM2P07951 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
TPM2P07951 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TPM2P07951 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TPM2P07951 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TPM2P07951 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TPM2P07951 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TPM2P07951 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TPM2P07951 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TPM2P07951 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TPM2P07951 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TPM2P07951 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TPM2P07951 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
TPM2P07951 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TPM2P07951 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TPM2P07951 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TPM2P07951 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TPM2P07951 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TPM2P07951 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TPM2P07951 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TPM2P07951 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
TPM2P07951 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TPM2P07951 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TPM2P07951 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TPM2P07951 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TPM2P07951 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TPM2P07951 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TPM2P07951 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TPM2P07951 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TPM2P07951 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TPM2P07951 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TPM2P07951 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
TPM2P07951 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TPM2P07951 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TPM2P07951 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TPM2P07951 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TPM2P07951 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TPM2P07951 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TPM2P07951 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TPM2P07951 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
TPM2P07951 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TPM2P07951 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TPM2P07951 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TPM2P07951 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TPM2P07951 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TPM2P07951 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TPM2P07951 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TPM2P07951 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TPM2P07951 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TPM2P07951 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TPM2P07951 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TPM2P07951 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TPM2P07951 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TPM2P07951 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TPM2P07951 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TPM2P07951 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TPM2P07951 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TPM2P07951 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TPM2P07951 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TPM2P07951 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TPM2P07951 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TPM2P07951 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TPM2P07951 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TPM2P07951 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TPM2P07951 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TPM2P07951 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TPM2P07951 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TPM2P07951 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TPM2P07951 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TPM2P07951 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TPM2P07951 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TPM2P07951 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TPM2P07951 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TPM2P07951 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms