Protein–RNA interactions for Protein: P00740

F9, Coagulation factor IX, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F9P00740 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
F9P00740 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
F9P00740 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
F9P00740 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
F9P00740 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
F9P00740 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
F9P00740 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
F9P00740 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
F9P00740 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
F9P00740 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
F9P00740 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
F9P00740 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
F9P00740 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
F9P00740 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
F9P00740 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
F9P00740 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
F9P00740 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
F9P00740 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
F9P00740 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
F9P00740 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
F9P00740 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
F9P00740 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
F9P00740 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
F9P00740 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
F9P00740 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
F9P00740 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
F9P00740 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
F9P00740 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
F9P00740 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
F9P00740 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
F9P00740 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
F9P00740 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
F9P00740 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
F9P00740 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
F9P00740 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
F9P00740 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
F9P00740 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
F9P00740 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
F9P00740 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
F9P00740 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
F9P00740 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
F9P00740 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
F9P00740 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
F9P00740 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
F9P00740 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
F9P00740 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
F9P00740 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
F9P00740 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
F9P00740 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
F9P00740 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
F9P00740 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
F9P00740 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
F9P00740 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
F9P00740 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
F9P00740 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
F9P00740 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
F9P00740 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
F9P00740 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
F9P00740 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
F9P00740 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
F9P00740 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
F9P00740 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
F9P00740 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
F9P00740 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
F9P00740 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
F9P00740 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
F9P00740 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
F9P00740 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
F9P00740 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
F9P00740 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
F9P00740 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
F9P00740 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
F9P00740 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
F9P00740 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
F9P00740 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
F9P00740 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
F9P00740 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
F9P00740 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
F9P00740 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
F9P00740 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
F9P00740 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
F9P00740 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
F9P00740 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
F9P00740 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
F9P00740 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
F9P00740 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
F9P00740 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
F9P00740 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
F9P00740 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
F9P00740 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
F9P00740 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
F9P00740 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
F9P00740 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
F9P00740 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
F9P00740 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
F9P00740 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
F9P00740 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
F9P00740 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
F9P00740 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
F9P00740 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.1 ms