Protein–RNA interactions for Protein: O95793

STAU1, Double-stranded RNA-binding protein Staufen homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAU1O95793 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
STAU1O95793 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
STAU1O95793 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
STAU1O95793 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
STAU1O95793 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
STAU1O95793 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
STAU1O95793 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
STAU1O95793 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
STAU1O95793 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
STAU1O95793 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
STAU1O95793 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
STAU1O95793 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
STAU1O95793 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
STAU1O95793 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
STAU1O95793 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
STAU1O95793 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
STAU1O95793 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
STAU1O95793 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
STAU1O95793 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
STAU1O95793 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
STAU1O95793 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
STAU1O95793 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
STAU1O95793 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
STAU1O95793 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
STAU1O95793 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
STAU1O95793 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
STAU1O95793 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
STAU1O95793 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
STAU1O95793 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
STAU1O95793 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
STAU1O95793 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
STAU1O95793 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
STAU1O95793 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
STAU1O95793 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
STAU1O95793 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
STAU1O95793 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
STAU1O95793 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
STAU1O95793 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
STAU1O95793 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
STAU1O95793 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
STAU1O95793 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
STAU1O95793 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
STAU1O95793 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
STAU1O95793 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
STAU1O95793 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
STAU1O95793 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
STAU1O95793 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
STAU1O95793 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
STAU1O95793 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
STAU1O95793 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
STAU1O95793 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
STAU1O95793 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
STAU1O95793 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
STAU1O95793 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
STAU1O95793 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
STAU1O95793 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
STAU1O95793 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
STAU1O95793 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
STAU1O95793 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
STAU1O95793 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
STAU1O95793 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
STAU1O95793 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
STAU1O95793 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
STAU1O95793 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
STAU1O95793 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
STAU1O95793 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
STAU1O95793 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
STAU1O95793 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
STAU1O95793 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
STAU1O95793 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
STAU1O95793 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
STAU1O95793 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
STAU1O95793 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
STAU1O95793 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
STAU1O95793 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
STAU1O95793 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
STAU1O95793 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
STAU1O95793 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
STAU1O95793 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
STAU1O95793 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
STAU1O95793 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
STAU1O95793 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
STAU1O95793 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
STAU1O95793 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
STAU1O95793 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
STAU1O95793 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
STAU1O95793 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
STAU1O95793 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
STAU1O95793 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
STAU1O95793 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
STAU1O95793 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
STAU1O95793 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
STAU1O95793 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
STAU1O95793 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
STAU1O95793 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
STAU1O95793 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
STAU1O95793 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
STAU1O95793 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
STAU1O95793 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
STAU1O95793 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms