Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG12O94817 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG12O94817 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG12O94817 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG12O94817 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG12O94817 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG12O94817 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG12O94817 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG12O94817 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG12O94817 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG12O94817 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG12O94817 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG12O94817 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG12O94817 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG12O94817 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG12O94817 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG12O94817 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG12O94817 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG12O94817 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG12O94817 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG12O94817 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG12O94817 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG12O94817 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG12O94817 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG12O94817 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG12O94817 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG12O94817 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG12O94817 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG12O94817 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG12O94817 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG12O94817 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG12O94817 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG12O94817 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG12O94817 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG12O94817 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG12O94817 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATG12O94817 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG12O94817 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG12O94817 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG12O94817 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG12O94817 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG12O94817 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG12O94817 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG12O94817 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG12O94817 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG12O94817 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG12O94817 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG12O94817 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG12O94817 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG12O94817 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG12O94817 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG12O94817 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG12O94817 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG12O94817 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG12O94817 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ATG12O94817 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG12O94817 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG12O94817 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG12O94817 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG12O94817 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG12O94817 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG12O94817 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG12O94817 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG12O94817 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG12O94817 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG12O94817 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG12O94817 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG12O94817 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG12O94817 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG12O94817 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG12O94817 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG12O94817 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG12O94817 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG12O94817 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG12O94817 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG12O94817 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG12O94817 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG12O94817 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG12O94817 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG12O94817 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG12O94817 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG12O94817 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG12O94817 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG12O94817 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG12O94817 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG12O94817 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG12O94817 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATG12O94817 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG12O94817 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG12O94817 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG12O94817 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG12O94817 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG12O94817 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG12O94817 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG12O94817 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG12O94817 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG12O94817 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG12O94817 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG12O94817 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATG12O94817 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms