Protein–RNA interactions for Protein: O75691

UTP20, Small subunit processome component 20 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP20O75691 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UTP20O75691 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UTP20O75691 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UTP20O75691 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UTP20O75691 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UTP20O75691 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UTP20O75691 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UTP20O75691 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UTP20O75691 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UTP20O75691 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UTP20O75691 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UTP20O75691 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UTP20O75691 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UTP20O75691 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
UTP20O75691 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UTP20O75691 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UTP20O75691 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UTP20O75691 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UTP20O75691 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
UTP20O75691 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UTP20O75691 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UTP20O75691 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UTP20O75691 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UTP20O75691 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UTP20O75691 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UTP20O75691 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UTP20O75691 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UTP20O75691 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UTP20O75691 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UTP20O75691 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UTP20O75691 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UTP20O75691 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UTP20O75691 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UTP20O75691 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UTP20O75691 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UTP20O75691 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UTP20O75691 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
UTP20O75691 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UTP20O75691 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UTP20O75691 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UTP20O75691 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UTP20O75691 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UTP20O75691 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UTP20O75691 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
UTP20O75691 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UTP20O75691 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UTP20O75691 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UTP20O75691 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UTP20O75691 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UTP20O75691 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UTP20O75691 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UTP20O75691 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UTP20O75691 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UTP20O75691 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UTP20O75691 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UTP20O75691 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UTP20O75691 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UTP20O75691 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UTP20O75691 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UTP20O75691 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UTP20O75691 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UTP20O75691 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UTP20O75691 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UTP20O75691 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
UTP20O75691 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
UTP20O75691 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
UTP20O75691 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UTP20O75691 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
UTP20O75691 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UTP20O75691 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UTP20O75691 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UTP20O75691 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UTP20O75691 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UTP20O75691 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UTP20O75691 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UTP20O75691 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UTP20O75691 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UTP20O75691 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UTP20O75691 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UTP20O75691 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UTP20O75691 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UTP20O75691 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UTP20O75691 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
UTP20O75691 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UTP20O75691 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UTP20O75691 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UTP20O75691 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UTP20O75691 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UTP20O75691 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UTP20O75691 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UTP20O75691 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UTP20O75691 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UTP20O75691 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UTP20O75691 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
UTP20O75691 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
UTP20O75691 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
UTP20O75691 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UTP20O75691 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UTP20O75691 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UTP20O75691 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms