Protein–RNA interactions for Protein: O60936

NOL3, Nucleolar protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOL3O60936 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOL3O60936 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NOL3O60936 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NOL3O60936 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NOL3O60936 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NOL3O60936 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NOL3O60936 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NOL3O60936 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NOL3O60936 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NOL3O60936 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NOL3O60936 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NOL3O60936 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NOL3O60936 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NOL3O60936 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NOL3O60936 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NOL3O60936 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NOL3O60936 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NOL3O60936 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NOL3O60936 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NOL3O60936 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NOL3O60936 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NOL3O60936 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NOL3O60936 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NOL3O60936 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NOL3O60936 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NOL3O60936 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NOL3O60936 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NOL3O60936 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NOL3O60936 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NOL3O60936 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NOL3O60936 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NOL3O60936 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NOL3O60936 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NOL3O60936 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NOL3O60936 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NOL3O60936 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NOL3O60936 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NOL3O60936 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NOL3O60936 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NOL3O60936 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NOL3O60936 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NOL3O60936 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NOL3O60936 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NOL3O60936 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NOL3O60936 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NOL3O60936 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NOL3O60936 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NOL3O60936 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NOL3O60936 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NOL3O60936 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NOL3O60936 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NOL3O60936 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NOL3O60936 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NOL3O60936 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NOL3O60936 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NOL3O60936 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NOL3O60936 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NOL3O60936 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NOL3O60936 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NOL3O60936 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NOL3O60936 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NOL3O60936 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOL3O60936 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOL3O60936 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOL3O60936 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NOL3O60936 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NOL3O60936 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NOL3O60936 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NOL3O60936 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NOL3O60936 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NOL3O60936 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NOL3O60936 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NOL3O60936 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NOL3O60936 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NOL3O60936 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NOL3O60936 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NOL3O60936 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NOL3O60936 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NOL3O60936 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NOL3O60936 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NOL3O60936 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NOL3O60936 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NOL3O60936 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NOL3O60936 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NOL3O60936 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NOL3O60936 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NOL3O60936 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NOL3O60936 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NOL3O60936 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NOL3O60936 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NOL3O60936 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NOL3O60936 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NOL3O60936 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NOL3O60936 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NOL3O60936 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NOL3O60936 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NOL3O60936 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NOL3O60936 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NOL3O60936 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NOL3O60936 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms