Protein–RNA interactions for Protein: O60732

MAGEC1, Melanoma-associated antigen C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEC1O60732 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
MAGEC1O60732 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
MAGEC1O60732 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
MAGEC1O60732 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MAGEC1O60732 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
MAGEC1O60732 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MAGEC1O60732 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MAGEC1O60732 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MAGEC1O60732 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
MAGEC1O60732 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
MAGEC1O60732 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MAGEC1O60732 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MAGEC1O60732 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MAGEC1O60732 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MAGEC1O60732 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MAGEC1O60732 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.55■■■□□ 2
MAGEC1O60732 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
MAGEC1O60732 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
MAGEC1O60732 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MAGEC1O60732 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
MAGEC1O60732 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MAGEC1O60732 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MAGEC1O60732 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MAGEC1O60732 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MAGEC1O60732 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MAGEC1O60732 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MAGEC1O60732 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MAGEC1O60732 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MAGEC1O60732 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MAGEC1O60732 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MAGEC1O60732 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MAGEC1O60732 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
MAGEC1O60732 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MAGEC1O60732 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MAGEC1O60732 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MAGEC1O60732 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MAGEC1O60732 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MAGEC1O60732 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
MAGEC1O60732 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MAGEC1O60732 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MAGEC1O60732 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
MAGEC1O60732 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MAGEC1O60732 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MAGEC1O60732 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MAGEC1O60732 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MAGEC1O60732 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MAGEC1O60732 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MAGEC1O60732 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MAGEC1O60732 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MAGEC1O60732 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MAGEC1O60732 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MAGEC1O60732 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
MAGEC1O60732 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MAGEC1O60732 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MAGEC1O60732 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MAGEC1O60732 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MAGEC1O60732 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MAGEC1O60732 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MAGEC1O60732 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MAGEC1O60732 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MAGEC1O60732 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MAGEC1O60732 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MAGEC1O60732 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MAGEC1O60732 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MAGEC1O60732 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MAGEC1O60732 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MAGEC1O60732 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MAGEC1O60732 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MAGEC1O60732 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MAGEC1O60732 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MAGEC1O60732 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MAGEC1O60732 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MAGEC1O60732 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MAGEC1O60732 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MAGEC1O60732 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MAGEC1O60732 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MAGEC1O60732 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MAGEC1O60732 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MAGEC1O60732 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MAGEC1O60732 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MAGEC1O60732 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MAGEC1O60732 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MAGEC1O60732 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MAGEC1O60732 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
MAGEC1O60732 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MAGEC1O60732 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MAGEC1O60732 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MAGEC1O60732 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MAGEC1O60732 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MAGEC1O60732 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MAGEC1O60732 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MAGEC1O60732 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MAGEC1O60732 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MAGEC1O60732 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
MAGEC1O60732 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MAGEC1O60732 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MAGEC1O60732 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MAGEC1O60732 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MAGEC1O60732 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MAGEC1O60732 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms