Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
GRIN3BO60391 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC34.57■■■■□ 3.12
GRIN3BO60391 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
GRIN3BO60391 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
GRIN3BO60391 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
GRIN3BO60391 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
GRIN3BO60391 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
GRIN3BO60391 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
GRIN3BO60391 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
GRIN3BO60391 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
GRIN3BO60391 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
GRIN3BO60391 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
GRIN3BO60391 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
GRIN3BO60391 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC34.47■■■■□ 3.11
GRIN3BO60391 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
GRIN3BO60391 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
GRIN3BO60391 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
GRIN3BO60391 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
GRIN3BO60391 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
GRIN3BO60391 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
GRIN3BO60391 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
GRIN3BO60391 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
GRIN3BO60391 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
GRIN3BO60391 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
GRIN3BO60391 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
GRIN3BO60391 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
GRIN3BO60391 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
GRIN3BO60391 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
GRIN3BO60391 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
GRIN3BO60391 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
GRIN3BO60391 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
GRIN3BO60391 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC34.3■■■■□ 3.08
GRIN3BO60391 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
GRIN3BO60391 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
GRIN3BO60391 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
GRIN3BO60391 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
GRIN3BO60391 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
GRIN3BO60391 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
GRIN3BO60391 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
GRIN3BO60391 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
GRIN3BO60391 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
GRIN3BO60391 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
GRIN3BO60391 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
GRIN3BO60391 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
GRIN3BO60391 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
GRIN3BO60391 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
GRIN3BO60391 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
GRIN3BO60391 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
GRIN3BO60391 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
GRIN3BO60391 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
GRIN3BO60391 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
GRIN3BO60391 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
GRIN3BO60391 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
GRIN3BO60391 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
GRIN3BO60391 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
GRIN3BO60391 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
GRIN3BO60391 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
GRIN3BO60391 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
GRIN3BO60391 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
GRIN3BO60391 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
GRIN3BO60391 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
GRIN3BO60391 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
GRIN3BO60391 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
GRIN3BO60391 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
GRIN3BO60391 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
GRIN3BO60391 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
GRIN3BO60391 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
GRIN3BO60391 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
GRIN3BO60391 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
GRIN3BO60391 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
GRIN3BO60391 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
GRIN3BO60391 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
GRIN3BO60391 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
GRIN3BO60391 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
GRIN3BO60391 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.04
GRIN3BO60391 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
GRIN3BO60391 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
GRIN3BO60391 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
GRIN3BO60391 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
GRIN3BO60391 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
GRIN3BO60391 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
GRIN3BO60391 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
GRIN3BO60391 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
GRIN3BO60391 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
GRIN3BO60391 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
GRIN3BO60391 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
GRIN3BO60391 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
GRIN3BO60391 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
GRIN3BO60391 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
GRIN3BO60391 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
GRIN3BO60391 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
GRIN3BO60391 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
GRIN3BO60391 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
GRIN3BO60391 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
GRIN3BO60391 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
GRIN3BO60391 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
GRIN3BO60391 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
GRIN3BO60391 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
GRIN3BO60391 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
GRIN3BO60391 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms