Protein–RNA interactions for Protein: O43920

NDUFS5, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS5O43920 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFS5O43920 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFS5O43920 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFS5O43920 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFS5O43920 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFS5O43920 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFS5O43920 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFS5O43920 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFS5O43920 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFS5O43920 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFS5O43920 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFS5O43920 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFS5O43920 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFS5O43920 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFS5O43920 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFS5O43920 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFS5O43920 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFS5O43920 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFS5O43920 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFS5O43920 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFS5O43920 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFS5O43920 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFS5O43920 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFS5O43920 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFS5O43920 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFS5O43920 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFS5O43920 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFS5O43920 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFS5O43920 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFS5O43920 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFS5O43920 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFS5O43920 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFS5O43920 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFS5O43920 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFS5O43920 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFS5O43920 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFS5O43920 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFS5O43920 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFS5O43920 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFS5O43920 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFS5O43920 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFS5O43920 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFS5O43920 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFS5O43920 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFS5O43920 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFS5O43920 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFS5O43920 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFS5O43920 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFS5O43920 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFS5O43920 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFS5O43920 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFS5O43920 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFS5O43920 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFS5O43920 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFS5O43920 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFS5O43920 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFS5O43920 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFS5O43920 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFS5O43920 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFS5O43920 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFS5O43920 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFS5O43920 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NDUFS5O43920 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NDUFS5O43920 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NDUFS5O43920 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NDUFS5O43920 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NDUFS5O43920 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NDUFS5O43920 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NDUFS5O43920 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDUFS5O43920 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDUFS5O43920 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFS5O43920 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDUFS5O43920 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS5O43920 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS5O43920 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS5O43920 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS5O43920 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFS5O43920 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFS5O43920 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFS5O43920 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFS5O43920 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFS5O43920 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFS5O43920 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFS5O43920 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFS5O43920 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFS5O43920 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFS5O43920 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFS5O43920 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFS5O43920 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFS5O43920 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFS5O43920 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFS5O43920 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFS5O43920 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFS5O43920 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDUFS5O43920 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NDUFS5O43920 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NDUFS5O43920 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NDUFS5O43920 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NDUFS5O43920 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NDUFS5O43920 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.5 ms