Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CTIFO43310 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CTIFO43310 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CTIFO43310 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CTIFO43310 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CTIFO43310 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CTIFO43310 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
CTIFO43310 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CTIFO43310 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CTIFO43310 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CTIFO43310 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CTIFO43310 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CTIFO43310 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CTIFO43310 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CTIFO43310 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CTIFO43310 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CTIFO43310 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CTIFO43310 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CTIFO43310 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CTIFO43310 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CTIFO43310 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CTIFO43310 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CTIFO43310 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CTIFO43310 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CTIFO43310 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CTIFO43310 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CTIFO43310 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CTIFO43310 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CTIFO43310 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CTIFO43310 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CTIFO43310 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CTIFO43310 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CTIFO43310 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CTIFO43310 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CTIFO43310 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CTIFO43310 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CTIFO43310 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CTIFO43310 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CTIFO43310 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CTIFO43310 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CTIFO43310 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CTIFO43310 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CTIFO43310 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CTIFO43310 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CTIFO43310 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CTIFO43310 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CTIFO43310 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CTIFO43310 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CTIFO43310 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CTIFO43310 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CTIFO43310 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CTIFO43310 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CTIFO43310 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CTIFO43310 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CTIFO43310 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CTIFO43310 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CTIFO43310 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CTIFO43310 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CTIFO43310 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CTIFO43310 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CTIFO43310 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CTIFO43310 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CTIFO43310 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CTIFO43310 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CTIFO43310 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CTIFO43310 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CTIFO43310 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CTIFO43310 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CTIFO43310 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CTIFO43310 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CTIFO43310 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTIFO43310 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTIFO43310 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CTIFO43310 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CTIFO43310 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CTIFO43310 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CTIFO43310 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CTIFO43310 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CTIFO43310 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CTIFO43310 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CTIFO43310 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CTIFO43310 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CTIFO43310 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CTIFO43310 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CTIFO43310 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CTIFO43310 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CTIFO43310 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CTIFO43310 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CTIFO43310 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CTIFO43310 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CTIFO43310 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CTIFO43310 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CTIFO43310 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CTIFO43310 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CTIFO43310 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CTIFO43310 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CTIFO43310 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CTIFO43310 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CTIFO43310 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CTIFO43310 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
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