Protein–RNA interactions for Protein: A8K830

COLCA2, Colorectal cancer-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLCA2A8K830 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COLCA2A8K830 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COLCA2A8K830 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COLCA2A8K830 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COLCA2A8K830 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COLCA2A8K830 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COLCA2A8K830 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COLCA2A8K830 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COLCA2A8K830 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COLCA2A8K830 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COLCA2A8K830 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COLCA2A8K830 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COLCA2A8K830 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COLCA2A8K830 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COLCA2A8K830 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COLCA2A8K830 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COLCA2A8K830 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COLCA2A8K830 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COLCA2A8K830 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COLCA2A8K830 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COLCA2A8K830 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COLCA2A8K830 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COLCA2A8K830 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COLCA2A8K830 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COLCA2A8K830 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
COLCA2A8K830 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
COLCA2A8K830 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COLCA2A8K830 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COLCA2A8K830 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
COLCA2A8K830 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COLCA2A8K830 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COLCA2A8K830 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COLCA2A8K830 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COLCA2A8K830 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COLCA2A8K830 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COLCA2A8K830 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COLCA2A8K830 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COLCA2A8K830 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.28■■□□□ 1
COLCA2A8K830 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COLCA2A8K830 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
COLCA2A8K830 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
COLCA2A8K830 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COLCA2A8K830 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COLCA2A8K830 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COLCA2A8K830 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COLCA2A8K830 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COLCA2A8K830 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COLCA2A8K830 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COLCA2A8K830 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COLCA2A8K830 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COLCA2A8K830 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COLCA2A8K830 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COLCA2A8K830 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COLCA2A8K830 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COLCA2A8K830 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COLCA2A8K830 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
COLCA2A8K830 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
COLCA2A8K830 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COLCA2A8K830 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COLCA2A8K830 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COLCA2A8K830 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COLCA2A8K830 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COLCA2A8K830 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COLCA2A8K830 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
COLCA2A8K830 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COLCA2A8K830 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COLCA2A8K830 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COLCA2A8K830 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COLCA2A8K830 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COLCA2A8K830 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COLCA2A8K830 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COLCA2A8K830 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COLCA2A8K830 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COLCA2A8K830 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
COLCA2A8K830 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
COLCA2A8K830 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
COLCA2A8K830 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COLCA2A8K830 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COLCA2A8K830 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COLCA2A8K830 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COLCA2A8K830 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COLCA2A8K830 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COLCA2A8K830 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COLCA2A8K830 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COLCA2A8K830 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COLCA2A8K830 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COLCA2A8K830 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COLCA2A8K830 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COLCA2A8K830 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COLCA2A8K830 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
COLCA2A8K830 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
COLCA2A8K830 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COLCA2A8K830 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COLCA2A8K830 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COLCA2A8K830 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COLCA2A8K830 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COLCA2A8K830 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COLCA2A8K830 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COLCA2A8K830 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COLCA2A8K830 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms