Protein–RNA interactions for Protein: A4D126

ISPD, D-ribitol-5-phosphate cytidylyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISPDA4D126 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ISPDA4D126 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ISPDA4D126 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ISPDA4D126 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ISPDA4D126 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ISPDA4D126 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ISPDA4D126 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ISPDA4D126 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ISPDA4D126 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ISPDA4D126 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ISPDA4D126 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ISPDA4D126 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ISPDA4D126 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ISPDA4D126 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ISPDA4D126 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ISPDA4D126 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ISPDA4D126 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ISPDA4D126 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ISPDA4D126 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ISPDA4D126 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ISPDA4D126 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ISPDA4D126 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ISPDA4D126 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ISPDA4D126 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ISPDA4D126 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ISPDA4D126 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ISPDA4D126 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ISPDA4D126 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ISPDA4D126 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ISPDA4D126 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ISPDA4D126 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ISPDA4D126 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ISPDA4D126 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ISPDA4D126 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ISPDA4D126 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ISPDA4D126 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ISPDA4D126 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ISPDA4D126 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ISPDA4D126 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ISPDA4D126 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ISPDA4D126 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ISPDA4D126 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ISPDA4D126 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ISPDA4D126 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ISPDA4D126 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ISPDA4D126 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ISPDA4D126 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ISPDA4D126 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ISPDA4D126 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ISPDA4D126 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ISPDA4D126 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ISPDA4D126 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ISPDA4D126 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ISPDA4D126 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ISPDA4D126 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ISPDA4D126 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ISPDA4D126 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ISPDA4D126 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ISPDA4D126 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ISPDA4D126 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ISPDA4D126 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ISPDA4D126 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ISPDA4D126 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ISPDA4D126 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ISPDA4D126 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ISPDA4D126 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ISPDA4D126 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ISPDA4D126 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ISPDA4D126 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ISPDA4D126 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ISPDA4D126 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ISPDA4D126 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ISPDA4D126 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ISPDA4D126 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ISPDA4D126 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ISPDA4D126 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ISPDA4D126 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ISPDA4D126 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ISPDA4D126 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ISPDA4D126 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ISPDA4D126 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ISPDA4D126 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ISPDA4D126 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ISPDA4D126 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ISPDA4D126 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ISPDA4D126 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ISPDA4D126 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ISPDA4D126 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ISPDA4D126 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ISPDA4D126 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ISPDA4D126 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ISPDA4D126 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ISPDA4D126 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ISPDA4D126 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ISPDA4D126 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ISPDA4D126 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ISPDA4D126 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ISPDA4D126 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ISPDA4D126 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ISPDA4D126 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms