Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQV1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
A0A0U1RQV1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
A0A0U1RQV1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
A0A0U1RQV1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
A0A0U1RQV1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
A0A0U1RQV1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
A0A0U1RQV1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
A0A0U1RQV1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
A0A0U1RQV1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
A0A0U1RQV1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
A0A0U1RQV1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
A0A0U1RQV1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A0A0U1RQV1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
A0A0U1RQV1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A0A0U1RQV1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
A0A0U1RQV1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A0A0U1RQV1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A0A0U1RQV1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A0A0U1RQV1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A0A0U1RQV1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0U1RQV1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0U1RQV1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A0A0U1RQV1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A0A0U1RQV1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A0A0U1RQV1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A0A0U1RQV1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A0A0U1RQV1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
A0A0U1RQV1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A0A0U1RQV1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A0A0U1RQV1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
A0A0U1RQV1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A0A0U1RQV1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A0A0U1RQV1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A0A0U1RQV1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A0A0U1RQV1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
A0A0U1RQV1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
A0A0U1RQV1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A0A0U1RQV1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A0A0U1RQV1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A0A0U1RQV1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
A0A0U1RQV1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A0A0U1RQV1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A0A0U1RQV1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A0A0U1RQV1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A0A0U1RQV1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A0A0U1RQV1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A0A0U1RQV1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
A0A0U1RQV1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0U1RQV1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0U1RQV1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0U1RQV1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0U1RQV1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A0U1RQV1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A0U1RQV1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0U1RQV1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0U1RQV1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0U1RQV1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0U1RQV1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0U1RQV1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0U1RQV1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0U1RQV1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0U1RQV1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0U1RQV1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0U1RQV1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0U1RQV1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0U1RQV1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0U1RQV1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0U1RQV1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0U1RQV1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0U1RQV1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0U1RQV1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0U1RQV1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0U1RQV1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0U1RQV1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A0U1RQV1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A0U1RQV1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A0U1RQV1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A0U1RQV1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A0U1RQV1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A0U1RQV1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A0U1RQV1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A0U1RQV1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A0U1RQV1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A0U1RQV1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A0U1RQV1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A0U1RQV1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A0A0U1RQV1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A0A0U1RQV1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A0A0U1RQV1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A0A0U1RQV1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A0A0U1RQV1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A0U1RQV1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0U1RQV1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0U1RQV1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0U1RQV1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0U1RQV1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0U1RQV1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0U1RQV1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0U1RQV1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0U1RQV1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms