Protein–RNA interactions for Protein: A0A0D9SG52

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0D9SG52 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0D9SG52 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0D9SG52 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0D9SG52 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0D9SG52 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0D9SG52 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0D9SG52 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0D9SG52 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0D9SG52 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0D9SG52 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0D9SG52 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0D9SG52 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0D9SG52 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0D9SG52 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
A0A0D9SG52 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0D9SG52 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A0D9SG52 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A0D9SG52 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A0D9SG52 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0D9SG52 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0D9SG52 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0D9SG52 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0D9SG52 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0D9SG52 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0D9SG52 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0D9SG52 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0D9SG52 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0D9SG52 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0D9SG52 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0D9SG52 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0D9SG52 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0D9SG52 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0D9SG52 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0D9SG52 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0D9SG52 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0D9SG52 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0D9SG52 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0D9SG52 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0D9SG52 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0D9SG52 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0D9SG52 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0D9SG52 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A0D9SG52 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0D9SG52 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0D9SG52 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0D9SG52 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0D9SG52 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0D9SG52 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0D9SG52 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0D9SG52 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0D9SG52 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0D9SG52 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0D9SG52 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0D9SG52 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0D9SG52 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0D9SG52 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0D9SG52 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0D9SG52 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0D9SG52 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A0D9SG52 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A0D9SG52 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A0D9SG52 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A0D9SG52 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A0D9SG52 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A0D9SG52 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A0D9SG52 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A0D9SG52 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A0D9SG52 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0D9SG52 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0D9SG52 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A0D9SG52 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A0D9SG52 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A0D9SG52 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A0D9SG52 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0D9SG52 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0D9SG52 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0D9SG52 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0D9SG52 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0D9SG52 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0D9SG52 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0D9SG52 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0D9SG52 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A0D9SG52 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A0D9SG52 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A0D9SG52 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
A0A0D9SG52 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
A0A0D9SG52 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
A0A0D9SG52 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A0D9SG52 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A0D9SG52 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A0D9SG52 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A0D9SG52 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A0D9SG52 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A0D9SG52 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A0D9SG52 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A0D9SG52 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A0D9SG52 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A0D9SG52 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A0D9SG52 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A0D9SG52 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms