Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CGGBP1Q9UFW8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CGGBP1Q9UFW8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CGGBP1Q9UFW8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CGGBP1Q9UFW8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CGGBP1Q9UFW8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CGGBP1Q9UFW8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CGGBP1Q9UFW8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CGGBP1Q9UFW8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CGGBP1Q9UFW8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CGGBP1Q9UFW8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CGGBP1Q9UFW8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CGGBP1Q9UFW8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CGGBP1Q9UFW8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CGGBP1Q9UFW8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CGGBP1Q9UFW8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CGGBP1Q9UFW8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CGGBP1Q9UFW8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CGGBP1Q9UFW8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CGGBP1Q9UFW8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CGGBP1Q9UFW8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CGGBP1Q9UFW8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CGGBP1Q9UFW8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CGGBP1Q9UFW8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CGGBP1Q9UFW8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CGGBP1Q9UFW8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CGGBP1Q9UFW8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
CGGBP1Q9UFW8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CGGBP1Q9UFW8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CGGBP1Q9UFW8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CGGBP1Q9UFW8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CGGBP1Q9UFW8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CGGBP1Q9UFW8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CGGBP1Q9UFW8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CGGBP1Q9UFW8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CGGBP1Q9UFW8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CGGBP1Q9UFW8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CGGBP1Q9UFW8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CGGBP1Q9UFW8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CGGBP1Q9UFW8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CGGBP1Q9UFW8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CGGBP1Q9UFW8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CGGBP1Q9UFW8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CGGBP1Q9UFW8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CGGBP1Q9UFW8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CGGBP1Q9UFW8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CGGBP1Q9UFW8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CGGBP1Q9UFW8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CGGBP1Q9UFW8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CGGBP1Q9UFW8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CGGBP1Q9UFW8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CGGBP1Q9UFW8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CGGBP1Q9UFW8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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