Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CASS4Q9NQ75 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASS4Q9NQ75 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASS4Q9NQ75 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CASS4Q9NQ75 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASS4Q9NQ75 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASS4Q9NQ75 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASS4Q9NQ75 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASS4Q9NQ75 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASS4Q9NQ75 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASS4Q9NQ75 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASS4Q9NQ75 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CASS4Q9NQ75 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CASS4Q9NQ75 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASS4Q9NQ75 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASS4Q9NQ75 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASS4Q9NQ75 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASS4Q9NQ75 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASS4Q9NQ75 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASS4Q9NQ75 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASS4Q9NQ75 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASS4Q9NQ75 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASS4Q9NQ75 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CASS4Q9NQ75 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASS4Q9NQ75 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASS4Q9NQ75 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASS4Q9NQ75 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASS4Q9NQ75 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASS4Q9NQ75 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASS4Q9NQ75 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASS4Q9NQ75 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASS4Q9NQ75 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASS4Q9NQ75 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASS4Q9NQ75 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASS4Q9NQ75 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASS4Q9NQ75 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASS4Q9NQ75 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASS4Q9NQ75 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CASS4Q9NQ75 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASS4Q9NQ75 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASS4Q9NQ75 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASS4Q9NQ75 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASS4Q9NQ75 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASS4Q9NQ75 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASS4Q9NQ75 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASS4Q9NQ75 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASS4Q9NQ75 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASS4Q9NQ75 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CASS4Q9NQ75 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASS4Q9NQ75 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASS4Q9NQ75 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASS4Q9NQ75 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CASS4Q9NQ75 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASS4Q9NQ75 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CASS4Q9NQ75 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASS4Q9NQ75 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASS4Q9NQ75 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CASS4Q9NQ75 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms