Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB31

SEBOX, Homeobox protein SEBOX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEBOXQ9HB31 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEBOXQ9HB31 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEBOXQ9HB31 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEBOXQ9HB31 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEBOXQ9HB31 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SEBOXQ9HB31 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SEBOXQ9HB31 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SEBOXQ9HB31 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SEBOXQ9HB31 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SEBOXQ9HB31 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SEBOXQ9HB31 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SEBOXQ9HB31 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SEBOXQ9HB31 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEBOXQ9HB31 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms