Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.9 ms