Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ0

KRTAP9-8, Keratin-associated protein 9-8, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-8Q9BYQ0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
KRTAP9-8Q9BYQ0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms