Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ3

USP30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP30Q70CQ3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP30Q70CQ3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP30Q70CQ3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP30Q70CQ3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP30Q70CQ3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP30Q70CQ3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP30Q70CQ3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP30Q70CQ3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP30Q70CQ3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP30Q70CQ3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP30Q70CQ3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP30Q70CQ3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
USP30Q70CQ3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP30Q70CQ3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP30Q70CQ3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP30Q70CQ3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP30Q70CQ3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP30Q70CQ3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP30Q70CQ3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP30Q70CQ3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP30Q70CQ3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP30Q70CQ3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP30Q70CQ3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP30Q70CQ3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP30Q70CQ3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP30Q70CQ3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP30Q70CQ3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
USP30Q70CQ3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP30Q70CQ3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP30Q70CQ3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP30Q70CQ3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP30Q70CQ3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP30Q70CQ3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP30Q70CQ3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP30Q70CQ3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP30Q70CQ3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
USP30Q70CQ3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP30Q70CQ3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP30Q70CQ3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP30Q70CQ3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP30Q70CQ3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP30Q70CQ3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP30Q70CQ3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP30Q70CQ3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP30Q70CQ3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP30Q70CQ3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP30Q70CQ3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP30Q70CQ3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP30Q70CQ3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP30Q70CQ3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP30Q70CQ3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP30Q70CQ3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP30Q70CQ3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP30Q70CQ3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP30Q70CQ3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP30Q70CQ3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP30Q70CQ3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP30Q70CQ3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
USP30Q70CQ3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP30Q70CQ3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP30Q70CQ3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP30Q70CQ3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP30Q70CQ3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP30Q70CQ3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP30Q70CQ3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
USP30Q70CQ3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP30Q70CQ3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
USP30Q70CQ3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP30Q70CQ3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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