Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
LRRC9Q6ZRR7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
LRRC9Q6ZRR7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
LRRC9Q6ZRR7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
LRRC9Q6ZRR7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
LRRC9Q6ZRR7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
LRRC9Q6ZRR7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
LRRC9Q6ZRR7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
LRRC9Q6ZRR7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
LRRC9Q6ZRR7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
LRRC9Q6ZRR7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
LRRC9Q6ZRR7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
LRRC9Q6ZRR7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
LRRC9Q6ZRR7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
LRRC9Q6ZRR7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
LRRC9Q6ZRR7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
LRRC9Q6ZRR7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
LRRC9Q6ZRR7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
LRRC9Q6ZRR7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
LRRC9Q6ZRR7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
LRRC9Q6ZRR7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
LRRC9Q6ZRR7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
LRRC9Q6ZRR7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC33.57■■■□□ 2.97
LRRC9Q6ZRR7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
LRRC9Q6ZRR7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
LRRC9Q6ZRR7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
LRRC9Q6ZRR7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
LRRC9Q6ZRR7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
LRRC9Q6ZRR7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
LRRC9Q6ZRR7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
LRRC9Q6ZRR7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
LRRC9Q6ZRR7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
LRRC9Q6ZRR7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
LRRC9Q6ZRR7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC33.56■■■□□ 2.96
LRRC9Q6ZRR7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
LRRC9Q6ZRR7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
LRRC9Q6ZRR7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
LRRC9Q6ZRR7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
LRRC9Q6ZRR7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
LRRC9Q6ZRR7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
LRRC9Q6ZRR7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
LRRC9Q6ZRR7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
LRRC9Q6ZRR7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC33.55■■■□□ 2.96
LRRC9Q6ZRR7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
LRRC9Q6ZRR7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
LRRC9Q6ZRR7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
LRRC9Q6ZRR7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
LRRC9Q6ZRR7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
LRRC9Q6ZRR7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
LRRC9Q6ZRR7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
LRRC9Q6ZRR7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
LRRC9Q6ZRR7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
LRRC9Q6ZRR7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
LRRC9Q6ZRR7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
LRRC9Q6ZRR7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
LRRC9Q6ZRR7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC33.52■■■□□ 2.96
LRRC9Q6ZRR7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
LRRC9Q6ZRR7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC33.52■■■□□ 2.96
LRRC9Q6ZRR7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
LRRC9Q6ZRR7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
LRRC9Q6ZRR7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
LRRC9Q6ZRR7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
LRRC9Q6ZRR7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
LRRC9Q6ZRR7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
LRRC9Q6ZRR7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
LRRC9Q6ZRR7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.96
LRRC9Q6ZRR7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.96
LRRC9Q6ZRR7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
LRRC9Q6ZRR7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
LRRC9Q6ZRR7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
LRRC9Q6ZRR7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
LRRC9Q6ZRR7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
LRRC9Q6ZRR7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
LRRC9Q6ZRR7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
LRRC9Q6ZRR7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
LRRC9Q6ZRR7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
LRRC9Q6ZRR7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
LRRC9Q6ZRR7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
LRRC9Q6ZRR7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
LRRC9Q6ZRR7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
LRRC9Q6ZRR7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
LRRC9Q6ZRR7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
LRRC9Q6ZRR7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
LRRC9Q6ZRR7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
LRRC9Q6ZRR7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
LRRC9Q6ZRR7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
LRRC9Q6ZRR7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
LRRC9Q6ZRR7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
LRRC9Q6ZRR7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
LRRC9Q6ZRR7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
LRRC9Q6ZRR7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC33.49■■■□□ 2.95
LRRC9Q6ZRR7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
LRRC9Q6ZRR7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
LRRC9Q6ZRR7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
LRRC9Q6ZRR7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
LRRC9Q6ZRR7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
LRRC9Q6ZRR7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
LRRC9Q6ZRR7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
LRRC9Q6ZRR7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
LRRC9Q6ZRR7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms