Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRSAM1Q6UWE0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRSAM1Q6UWE0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRSAM1Q6UWE0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRSAM1Q6UWE0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRSAM1Q6UWE0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRSAM1Q6UWE0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRSAM1Q6UWE0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
LRSAM1Q6UWE0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRSAM1Q6UWE0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRSAM1Q6UWE0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRSAM1Q6UWE0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRSAM1Q6UWE0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRSAM1Q6UWE0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRSAM1Q6UWE0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRSAM1Q6UWE0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRSAM1Q6UWE0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRSAM1Q6UWE0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRSAM1Q6UWE0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRSAM1Q6UWE0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRSAM1Q6UWE0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRSAM1Q6UWE0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRSAM1Q6UWE0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRSAM1Q6UWE0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRSAM1Q6UWE0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRSAM1Q6UWE0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRSAM1Q6UWE0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRSAM1Q6UWE0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRSAM1Q6UWE0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRSAM1Q6UWE0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRSAM1Q6UWE0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRSAM1Q6UWE0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRSAM1Q6UWE0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRSAM1Q6UWE0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRSAM1Q6UWE0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRSAM1Q6UWE0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRSAM1Q6UWE0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRSAM1Q6UWE0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRSAM1Q6UWE0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRSAM1Q6UWE0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRSAM1Q6UWE0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRSAM1Q6UWE0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRSAM1Q6UWE0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRSAM1Q6UWE0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRSAM1Q6UWE0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LRSAM1Q6UWE0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRSAM1Q6UWE0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRSAM1Q6UWE0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRSAM1Q6UWE0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRSAM1Q6UWE0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRSAM1Q6UWE0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRSAM1Q6UWE0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRSAM1Q6UWE0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LRSAM1Q6UWE0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRSAM1Q6UWE0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRSAM1Q6UWE0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRSAM1Q6UWE0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRSAM1Q6UWE0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRSAM1Q6UWE0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRSAM1Q6UWE0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRSAM1Q6UWE0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRSAM1Q6UWE0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LRSAM1Q6UWE0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRSAM1Q6UWE0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRSAM1Q6UWE0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LRSAM1Q6UWE0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LRSAM1Q6UWE0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LRSAM1Q6UWE0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRSAM1Q6UWE0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRSAM1Q6UWE0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRSAM1Q6UWE0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRSAM1Q6UWE0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRSAM1Q6UWE0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRSAM1Q6UWE0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRSAM1Q6UWE0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRSAM1Q6UWE0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LRSAM1Q6UWE0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRSAM1Q6UWE0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRSAM1Q6UWE0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRSAM1Q6UWE0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRSAM1Q6UWE0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRSAM1Q6UWE0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRSAM1Q6UWE0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRSAM1Q6UWE0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRSAM1Q6UWE0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRSAM1Q6UWE0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRSAM1Q6UWE0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRSAM1Q6UWE0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRSAM1Q6UWE0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LRSAM1Q6UWE0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRSAM1Q6UWE0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRSAM1Q6UWE0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRSAM1Q6UWE0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRSAM1Q6UWE0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRSAM1Q6UWE0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRSAM1Q6UWE0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRSAM1Q6UWE0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRSAM1Q6UWE0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRSAM1Q6UWE0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRSAM1Q6UWE0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms