Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ2

PHLDB3, Pleckstrin homology-like domain family B member 3, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDB3Q6NSJ2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHLDB3Q6NSJ2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHLDB3Q6NSJ2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHLDB3Q6NSJ2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHLDB3Q6NSJ2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHLDB3Q6NSJ2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHLDB3Q6NSJ2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHLDB3Q6NSJ2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PHLDB3Q6NSJ2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHLDB3Q6NSJ2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHLDB3Q6NSJ2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHLDB3Q6NSJ2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHLDB3Q6NSJ2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHLDB3Q6NSJ2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHLDB3Q6NSJ2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHLDB3Q6NSJ2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHLDB3Q6NSJ2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHLDB3Q6NSJ2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHLDB3Q6NSJ2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHLDB3Q6NSJ2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHLDB3Q6NSJ2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHLDB3Q6NSJ2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHLDB3Q6NSJ2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHLDB3Q6NSJ2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHLDB3Q6NSJ2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHLDB3Q6NSJ2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHLDB3Q6NSJ2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHLDB3Q6NSJ2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHLDB3Q6NSJ2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHLDB3Q6NSJ2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHLDB3Q6NSJ2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHLDB3Q6NSJ2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHLDB3Q6NSJ2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHLDB3Q6NSJ2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHLDB3Q6NSJ2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHLDB3Q6NSJ2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHLDB3Q6NSJ2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHLDB3Q6NSJ2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHLDB3Q6NSJ2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PHLDB3Q6NSJ2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PHLDB3Q6NSJ2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PHLDB3Q6NSJ2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHLDB3Q6NSJ2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHLDB3Q6NSJ2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHLDB3Q6NSJ2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHLDB3Q6NSJ2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHLDB3Q6NSJ2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHLDB3Q6NSJ2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHLDB3Q6NSJ2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHLDB3Q6NSJ2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHLDB3Q6NSJ2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHLDB3Q6NSJ2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PHLDB3Q6NSJ2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHLDB3Q6NSJ2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHLDB3Q6NSJ2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHLDB3Q6NSJ2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHLDB3Q6NSJ2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHLDB3Q6NSJ2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHLDB3Q6NSJ2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHLDB3Q6NSJ2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHLDB3Q6NSJ2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHLDB3Q6NSJ2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHLDB3Q6NSJ2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHLDB3Q6NSJ2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHLDB3Q6NSJ2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHLDB3Q6NSJ2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHLDB3Q6NSJ2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PHLDB3Q6NSJ2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHLDB3Q6NSJ2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHLDB3Q6NSJ2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHLDB3Q6NSJ2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHLDB3Q6NSJ2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHLDB3Q6NSJ2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHLDB3Q6NSJ2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PHLDB3Q6NSJ2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHLDB3Q6NSJ2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHLDB3Q6NSJ2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHLDB3Q6NSJ2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHLDB3Q6NSJ2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHLDB3Q6NSJ2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHLDB3Q6NSJ2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHLDB3Q6NSJ2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHLDB3Q6NSJ2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHLDB3Q6NSJ2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHLDB3Q6NSJ2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHLDB3Q6NSJ2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHLDB3Q6NSJ2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHLDB3Q6NSJ2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHLDB3Q6NSJ2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHLDB3Q6NSJ2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHLDB3Q6NSJ2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHLDB3Q6NSJ2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHLDB3Q6NSJ2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHLDB3Q6NSJ2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHLDB3Q6NSJ2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHLDB3Q6NSJ2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHLDB3Q6NSJ2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHLDB3Q6NSJ2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHLDB3Q6NSJ2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHLDB3Q6NSJ2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1265.7 ms